Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smim11aQ99J19 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smim11aQ99J19 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Smim11aQ99J19 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smim11aQ99J19 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smim11aQ99J19 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smim11aQ99J19 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smim11aQ99J19 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smim11aQ99J19 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smim11aQ99J19 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smim11aQ99J19 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smim11aQ99J19 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smim11aQ99J19 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smim11aQ99J19 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smim11aQ99J19 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smim11aQ99J19 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smim11aQ99J19 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smim11aQ99J19 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Smim11aQ99J19 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smim11aQ99J19 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smim11aQ99J19 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smim11aQ99J19 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smim11aQ99J19 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smim11aQ99J19 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smim11aQ99J19 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smim11aQ99J19 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smim11aQ99J19 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smim11aQ99J19 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smim11aQ99J19 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smim11aQ99J19 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smim11aQ99J19 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smim11aQ99J19 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smim11aQ99J19 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smim11aQ99J19 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smim11aQ99J19 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smim11aQ99J19 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smim11aQ99J19 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smim11aQ99J19 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smim11aQ99J19 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smim11aQ99J19 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smim11aQ99J19 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smim11aQ99J19 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Smim11aQ99J19 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smim11aQ99J19 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smim11aQ99J19 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smim11aQ99J19 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Smim11aQ99J19 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smim11aQ99J19 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smim11aQ99J19 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smim11aQ99J19 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smim11aQ99J19 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smim11aQ99J19 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Smim11aQ99J19 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smim11aQ99J19 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smim11aQ99J19 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smim11aQ99J19 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smim11aQ99J19 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smim11aQ99J19 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smim11aQ99J19 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smim11aQ99J19 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smim11aQ99J19 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smim11aQ99J19 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smim11aQ99J19 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Smim11aQ99J19 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smim11aQ99J19 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smim11aQ99J19 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smim11aQ99J19 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smim11aQ99J19 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smim11aQ99J19 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smim11aQ99J19 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smim11aQ99J19 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smim11aQ99J19 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smim11aQ99J19 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smim11aQ99J19 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smim11aQ99J19 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smim11aQ99J19 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smim11aQ99J19 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smim11aQ99J19 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smim11aQ99J19 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Smim11aQ99J19 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smim11aQ99J19 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smim11aQ99J19 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smim11aQ99J19 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smim11aQ99J19 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smim11aQ99J19 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smim11aQ99J19 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smim11aQ99J19 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smim11aQ99J19 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smim11aQ99J19 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smim11aQ99J19 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smim11aQ99J19 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smim11aQ99J19 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smim11aQ99J19 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smim11aQ99J19 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smim11aQ99J19 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smim11aQ99J19 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smim11aQ99J19 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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