Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Csmd1Q923L3 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Csmd1Q923L3 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Csmd1Q923L3 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Csmd1Q923L3 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Csmd1Q923L3 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Csmd1Q923L3 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Csmd1Q923L3 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Csmd1Q923L3 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Csmd1Q923L3 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Csmd1Q923L3 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Csmd1Q923L3 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Csmd1Q923L3 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Csmd1Q923L3 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Csmd1Q923L3 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Csmd1Q923L3 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Csmd1Q923L3 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Csmd1Q923L3 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Csmd1Q923L3 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Csmd1Q923L3 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Csmd1Q923L3 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Csmd1Q923L3 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Csmd1Q923L3 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Csmd1Q923L3 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Csmd1Q923L3 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Csmd1Q923L3 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Csmd1Q923L3 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Csmd1Q923L3 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Csmd1Q923L3 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Csmd1Q923L3 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Csmd1Q923L3 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Csmd1Q923L3 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Csmd1Q923L3 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Csmd1Q923L3 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Csmd1Q923L3 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Csmd1Q923L3 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Csmd1Q923L3 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Csmd1Q923L3 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Csmd1Q923L3 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Csmd1Q923L3 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Csmd1Q923L3 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Csmd1Q923L3 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Csmd1Q923L3 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Csmd1Q923L3 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Csmd1Q923L3 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Csmd1Q923L3 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Csmd1Q923L3 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Csmd1Q923L3 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Csmd1Q923L3 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Csmd1Q923L3 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Csmd1Q923L3 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Csmd1Q923L3 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Csmd1Q923L3 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Csmd1Q923L3 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Csmd1Q923L3 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Csmd1Q923L3 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Csmd1Q923L3 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Csmd1Q923L3 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Csmd1Q923L3 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Csmd1Q923L3 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Csmd1Q923L3 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Csmd1Q923L3 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Csmd1Q923L3 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Csmd1Q923L3 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Csmd1Q923L3 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Csmd1Q923L3 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Csmd1Q923L3 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Csmd1Q923L3 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Csmd1Q923L3 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
Csmd1Q923L3 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
Csmd1Q923L3 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
Csmd1Q923L3 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
Csmd1Q923L3 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
Csmd1Q923L3 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
Csmd1Q923L3 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
Csmd1Q923L3 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
Csmd1Q923L3 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
Csmd1Q923L3 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Csmd1Q923L3 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
Csmd1Q923L3 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
Csmd1Q923L3 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
Csmd1Q923L3 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
Csmd1Q923L3 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
Csmd1Q923L3 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
Csmd1Q923L3 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
Csmd1Q923L3 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
Csmd1Q923L3 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
Csmd1Q923L3 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
Csmd1Q923L3 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
Csmd1Q923L3 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
Csmd1Q923L3 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
Csmd1Q923L3 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
Csmd1Q923L3 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
Csmd1Q923L3 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
Csmd1Q923L3 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
Csmd1Q923L3 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
Csmd1Q923L3 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
Csmd1Q923L3 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
Csmd1Q923L3 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
Csmd1Q923L3 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms