Protein–RNA interactions for Protein: Q923B3

Nrif1, Neurotrophin receptor-interacting factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 828 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrif1Q923B3 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nrif1Q923B3 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nrif1Q923B3 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nrif1Q923B3 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nrif1Q923B3 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nrif1Q923B3 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nrif1Q923B3 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nrif1Q923B3 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nrif1Q923B3 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nrif1Q923B3 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nrif1Q923B3 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nrif1Q923B3 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nrif1Q923B3 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nrif1Q923B3 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nrif1Q923B3 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nrif1Q923B3 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nrif1Q923B3 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Nrif1Q923B3 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nrif1Q923B3 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nrif1Q923B3 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nrif1Q923B3 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Nrif1Q923B3 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nrif1Q923B3 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nrif1Q923B3 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Nrif1Q923B3 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nrif1Q923B3 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nrif1Q923B3 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nrif1Q923B3 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nrif1Q923B3 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nrif1Q923B3 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nrif1Q923B3 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nrif1Q923B3 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nrif1Q923B3 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nrif1Q923B3 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nrif1Q923B3 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nrif1Q923B3 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nrif1Q923B3 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nrif1Q923B3 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nrif1Q923B3 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Nrif1Q923B3 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nrif1Q923B3 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nrif1Q923B3 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nrif1Q923B3 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nrif1Q923B3 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nrif1Q923B3 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nrif1Q923B3 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nrif1Q923B3 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nrif1Q923B3 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nrif1Q923B3 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nrif1Q923B3 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nrif1Q923B3 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nrif1Q923B3 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nrif1Q923B3 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nrif1Q923B3 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Nrif1Q923B3 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nrif1Q923B3 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nrif1Q923B3 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nrif1Q923B3 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nrif1Q923B3 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nrif1Q923B3 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nrif1Q923B3 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nrif1Q923B3 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Nrif1Q923B3 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nrif1Q923B3 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nrif1Q923B3 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nrif1Q923B3 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nrif1Q923B3 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nrif1Q923B3 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nrif1Q923B3 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nrif1Q923B3 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nrif1Q923B3 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nrif1Q923B3 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nrif1Q923B3 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nrif1Q923B3 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nrif1Q923B3 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nrif1Q923B3 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nrif1Q923B3 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Nrif1Q923B3 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nrif1Q923B3 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nrif1Q923B3 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nrif1Q923B3 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nrif1Q923B3 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nrif1Q923B3 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nrif1Q923B3 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nrif1Q923B3 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nrif1Q923B3 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nrif1Q923B3 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nrif1Q923B3 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nrif1Q923B3 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nrif1Q923B3 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nrif1Q923B3 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nrif1Q923B3 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nrif1Q923B3 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nrif1Q923B3 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nrif1Q923B3 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nrif1Q923B3 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nrif1Q923B3 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nrif1Q923B3 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nrif1Q923B3 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nrif1Q923B3 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms