Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y1

Ubxn1, UBX domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn1Q922Y1 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ubxn1Q922Y1 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ubxn1Q922Y1 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ubxn1Q922Y1 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ubxn1Q922Y1 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ubxn1Q922Y1 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ubxn1Q922Y1 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ubxn1Q922Y1 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ubxn1Q922Y1 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ubxn1Q922Y1 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ubxn1Q922Y1 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ubxn1Q922Y1 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ubxn1Q922Y1 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ubxn1Q922Y1 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Ubxn1Q922Y1 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ubxn1Q922Y1 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ubxn1Q922Y1 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Ubxn1Q922Y1 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ubxn1Q922Y1 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ubxn1Q922Y1 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ubxn1Q922Y1 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ubxn1Q922Y1 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ubxn1Q922Y1 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ubxn1Q922Y1 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ubxn1Q922Y1 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ubxn1Q922Y1 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ubxn1Q922Y1 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ubxn1Q922Y1 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC17■□□□□ 0.31
Ubxn1Q922Y1 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ubxn1Q922Y1 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ubxn1Q922Y1 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ubxn1Q922Y1 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ubxn1Q922Y1 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ubxn1Q922Y1 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ubxn1Q922Y1 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ubxn1Q922Y1 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ubxn1Q922Y1 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ubxn1Q922Y1 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ubxn1Q922Y1 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ubxn1Q922Y1 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ubxn1Q922Y1 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ubxn1Q922Y1 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ubxn1Q922Y1 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ubxn1Q922Y1 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ubxn1Q922Y1 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ubxn1Q922Y1 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ubxn1Q922Y1 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ubxn1Q922Y1 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ubxn1Q922Y1 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ubxn1Q922Y1 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ubxn1Q922Y1 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ubxn1Q922Y1 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ubxn1Q922Y1 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ubxn1Q922Y1 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ubxn1Q922Y1 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ubxn1Q922Y1 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ubxn1Q922Y1 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ubxn1Q922Y1 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ubxn1Q922Y1 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ubxn1Q922Y1 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ubxn1Q922Y1 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ubxn1Q922Y1 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ubxn1Q922Y1 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ubxn1Q922Y1 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ubxn1Q922Y1 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ubxn1Q922Y1 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ubxn1Q922Y1 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ubxn1Q922Y1 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ubxn1Q922Y1 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ubxn1Q922Y1 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ubxn1Q922Y1 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ubxn1Q922Y1 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ubxn1Q922Y1 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ubxn1Q922Y1 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ubxn1Q922Y1 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ubxn1Q922Y1 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ubxn1Q922Y1 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ubxn1Q922Y1 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ubxn1Q922Y1 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ubxn1Q922Y1 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ubxn1Q922Y1 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ubxn1Q922Y1 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ubxn1Q922Y1 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ubxn1Q922Y1 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ubxn1Q922Y1 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ubxn1Q922Y1 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ubxn1Q922Y1 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ubxn1Q922Y1 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ubxn1Q922Y1 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ubxn1Q922Y1 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ubxn1Q922Y1 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ubxn1Q922Y1 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ubxn1Q922Y1 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ubxn1Q922Y1 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ubxn1Q922Y1 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ubxn1Q922Y1 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ubxn1Q922Y1 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ubxn1Q922Y1 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ubxn1Q922Y1 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ubxn1Q922Y1 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms