Protein–RNA interactions for Protein: Q920A7

Afg3l1, AFG3-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 789 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg3l1Q920A7 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Afg3l1Q920A7 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Afg3l1Q920A7 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Afg3l1Q920A7 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Afg3l1Q920A7 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Afg3l1Q920A7 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Afg3l1Q920A7 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Afg3l1Q920A7 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Afg3l1Q920A7 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Afg3l1Q920A7 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Afg3l1Q920A7 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Afg3l1Q920A7 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Afg3l1Q920A7 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Afg3l1Q920A7 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Afg3l1Q920A7 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Afg3l1Q920A7 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Afg3l1Q920A7 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Afg3l1Q920A7 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Afg3l1Q920A7 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Afg3l1Q920A7 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Afg3l1Q920A7 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Afg3l1Q920A7 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Afg3l1Q920A7 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Afg3l1Q920A7 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Afg3l1Q920A7 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Afg3l1Q920A7 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Afg3l1Q920A7 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Afg3l1Q920A7 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Afg3l1Q920A7 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Afg3l1Q920A7 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Afg3l1Q920A7 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Afg3l1Q920A7 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Afg3l1Q920A7 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Afg3l1Q920A7 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Afg3l1Q920A7 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Afg3l1Q920A7 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Afg3l1Q920A7 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Afg3l1Q920A7 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Afg3l1Q920A7 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Afg3l1Q920A7 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Afg3l1Q920A7 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Afg3l1Q920A7 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Afg3l1Q920A7 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Afg3l1Q920A7 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Afg3l1Q920A7 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Afg3l1Q920A7 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Afg3l1Q920A7 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Afg3l1Q920A7 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Afg3l1Q920A7 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Afg3l1Q920A7 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Afg3l1Q920A7 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Afg3l1Q920A7 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Afg3l1Q920A7 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Afg3l1Q920A7 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Afg3l1Q920A7 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Afg3l1Q920A7 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Afg3l1Q920A7 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Afg3l1Q920A7 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Afg3l1Q920A7 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Afg3l1Q920A7 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Afg3l1Q920A7 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Afg3l1Q920A7 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Afg3l1Q920A7 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Afg3l1Q920A7 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
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Afg3l1Q920A7 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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Afg3l1Q920A7 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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Afg3l1Q920A7 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Afg3l1Q920A7 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Afg3l1Q920A7 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Afg3l1Q920A7 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Afg3l1Q920A7 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Afg3l1Q920A7 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Afg3l1Q920A7 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Afg3l1Q920A7 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Afg3l1Q920A7 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Afg3l1Q920A7 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Afg3l1Q920A7 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Afg3l1Q920A7 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Afg3l1Q920A7 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Afg3l1Q920A7 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Afg3l1Q920A7 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Afg3l1Q920A7 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Afg3l1Q920A7 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Afg3l1Q920A7 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Afg3l1Q920A7 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Afg3l1Q920A7 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Afg3l1Q920A7 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Afg3l1Q920A7 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Afg3l1Q920A7 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Afg3l1Q920A7 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Afg3l1Q920A7 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Afg3l1Q920A7 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Afg3l1Q920A7 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Afg3l1Q920A7 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Afg3l1Q920A7 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
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