Protein–RNA interactions for Protein: Q91YJ2

Snx4, Sorting nexin-4, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx4Q91YJ2 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx4Q91YJ2 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx4Q91YJ2 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx4Q91YJ2 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx4Q91YJ2 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx4Q91YJ2 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx4Q91YJ2 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx4Q91YJ2 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx4Q91YJ2 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx4Q91YJ2 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx4Q91YJ2 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx4Q91YJ2 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx4Q91YJ2 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx4Q91YJ2 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx4Q91YJ2 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx4Q91YJ2 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx4Q91YJ2 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx4Q91YJ2 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx4Q91YJ2 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx4Q91YJ2 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx4Q91YJ2 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx4Q91YJ2 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx4Q91YJ2 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx4Q91YJ2 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx4Q91YJ2 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx4Q91YJ2 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx4Q91YJ2 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx4Q91YJ2 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx4Q91YJ2 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx4Q91YJ2 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx4Q91YJ2 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx4Q91YJ2 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx4Q91YJ2 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx4Q91YJ2 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx4Q91YJ2 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx4Q91YJ2 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx4Q91YJ2 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx4Q91YJ2 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx4Q91YJ2 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx4Q91YJ2 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx4Q91YJ2 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx4Q91YJ2 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx4Q91YJ2 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx4Q91YJ2 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx4Q91YJ2 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx4Q91YJ2 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx4Q91YJ2 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx4Q91YJ2 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx4Q91YJ2 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx4Q91YJ2 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx4Q91YJ2 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx4Q91YJ2 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx4Q91YJ2 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx4Q91YJ2 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx4Q91YJ2 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx4Q91YJ2 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx4Q91YJ2 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx4Q91YJ2 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx4Q91YJ2 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx4Q91YJ2 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx4Q91YJ2 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx4Q91YJ2 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx4Q91YJ2 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx4Q91YJ2 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx4Q91YJ2 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx4Q91YJ2 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx4Q91YJ2 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx4Q91YJ2 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx4Q91YJ2 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx4Q91YJ2 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx4Q91YJ2 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx4Q91YJ2 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx4Q91YJ2 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx4Q91YJ2 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx4Q91YJ2 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx4Q91YJ2 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx4Q91YJ2 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx4Q91YJ2 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx4Q91YJ2 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx4Q91YJ2 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx4Q91YJ2 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx4Q91YJ2 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx4Q91YJ2 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx4Q91YJ2 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx4Q91YJ2 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx4Q91YJ2 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx4Q91YJ2 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx4Q91YJ2 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx4Q91YJ2 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx4Q91YJ2 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx4Q91YJ2 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx4Q91YJ2 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx4Q91YJ2 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx4Q91YJ2 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx4Q91YJ2 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx4Q91YJ2 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx4Q91YJ2 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx4Q91YJ2 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx4Q91YJ2 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx4Q91YJ2 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms