Protein–RNA interactions for Protein: Q91YH5

Atl3, Atlastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl3Q91YH5 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Atl3Q91YH5 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Atl3Q91YH5 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Atl3Q91YH5 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Atl3Q91YH5 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Atl3Q91YH5 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Atl3Q91YH5 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Atl3Q91YH5 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Atl3Q91YH5 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Atl3Q91YH5 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Atl3Q91YH5 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Atl3Q91YH5 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Atl3Q91YH5 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Atl3Q91YH5 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Atl3Q91YH5 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Atl3Q91YH5 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Atl3Q91YH5 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Atl3Q91YH5 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Atl3Q91YH5 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Atl3Q91YH5 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Atl3Q91YH5 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Atl3Q91YH5 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Atl3Q91YH5 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Atl3Q91YH5 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Atl3Q91YH5 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Atl3Q91YH5 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Atl3Q91YH5 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Atl3Q91YH5 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Atl3Q91YH5 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Atl3Q91YH5 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Atl3Q91YH5 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Atl3Q91YH5 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Atl3Q91YH5 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Atl3Q91YH5 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Atl3Q91YH5 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Atl3Q91YH5 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Atl3Q91YH5 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Atl3Q91YH5 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Atl3Q91YH5 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Atl3Q91YH5 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Atl3Q91YH5 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Atl3Q91YH5 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Atl3Q91YH5 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Atl3Q91YH5 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Atl3Q91YH5 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Atl3Q91YH5 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Atl3Q91YH5 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Atl3Q91YH5 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Atl3Q91YH5 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Atl3Q91YH5 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Atl3Q91YH5 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Atl3Q91YH5 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Atl3Q91YH5 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Atl3Q91YH5 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Atl3Q91YH5 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Atl3Q91YH5 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Atl3Q91YH5 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Atl3Q91YH5 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Atl3Q91YH5 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Atl3Q91YH5 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Atl3Q91YH5 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Atl3Q91YH5 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Atl3Q91YH5 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Atl3Q91YH5 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Atl3Q91YH5 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Atl3Q91YH5 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Atl3Q91YH5 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Atl3Q91YH5 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Atl3Q91YH5 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Atl3Q91YH5 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Atl3Q91YH5 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Atl3Q91YH5 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Atl3Q91YH5 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Atl3Q91YH5 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Atl3Q91YH5 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Atl3Q91YH5 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Atl3Q91YH5 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Atl3Q91YH5 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Atl3Q91YH5 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Atl3Q91YH5 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Atl3Q91YH5 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Atl3Q91YH5 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Atl3Q91YH5 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Atl3Q91YH5 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Atl3Q91YH5 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Atl3Q91YH5 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Atl3Q91YH5 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Atl3Q91YH5 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Atl3Q91YH5 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Atl3Q91YH5 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Atl3Q91YH5 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Atl3Q91YH5 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Atl3Q91YH5 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Atl3Q91YH5 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Atl3Q91YH5 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Atl3Q91YH5 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Atl3Q91YH5 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Atl3Q91YH5 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Atl3Q91YH5 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Atl3Q91YH5 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms