Protein–RNA interactions for Protein: Q91Y12

Pcdha8, Protocadherin alpha 8, mousemouse

Predictions only

Length 946 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdha8Q91Y12 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pcdha8Q91Y12 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pcdha8Q91Y12 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pcdha8Q91Y12 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pcdha8Q91Y12 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pcdha8Q91Y12 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pcdha8Q91Y12 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pcdha8Q91Y12 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pcdha8Q91Y12 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pcdha8Q91Y12 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcdha8Q91Y12 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcdha8Q91Y12 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcdha8Q91Y12 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcdha8Q91Y12 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcdha8Q91Y12 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcdha8Q91Y12 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcdha8Q91Y12 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcdha8Q91Y12 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcdha8Q91Y12 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcdha8Q91Y12 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcdha8Q91Y12 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcdha8Q91Y12 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcdha8Q91Y12 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcdha8Q91Y12 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcdha8Q91Y12 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcdha8Q91Y12 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcdha8Q91Y12 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcdha8Q91Y12 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcdha8Q91Y12 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcdha8Q91Y12 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcdha8Q91Y12 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcdha8Q91Y12 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcdha8Q91Y12 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcdha8Q91Y12 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcdha8Q91Y12 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcdha8Q91Y12 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcdha8Q91Y12 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcdha8Q91Y12 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcdha8Q91Y12 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcdha8Q91Y12 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcdha8Q91Y12 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcdha8Q91Y12 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcdha8Q91Y12 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcdha8Q91Y12 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcdha8Q91Y12 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcdha8Q91Y12 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcdha8Q91Y12 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcdha8Q91Y12 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcdha8Q91Y12 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcdha8Q91Y12 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcdha8Q91Y12 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcdha8Q91Y12 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcdha8Q91Y12 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcdha8Q91Y12 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcdha8Q91Y12 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcdha8Q91Y12 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcdha8Q91Y12 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcdha8Q91Y12 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcdha8Q91Y12 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcdha8Q91Y12 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcdha8Q91Y12 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcdha8Q91Y12 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcdha8Q91Y12 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcdha8Q91Y12 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcdha8Q91Y12 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcdha8Q91Y12 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcdha8Q91Y12 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcdha8Q91Y12 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcdha8Q91Y12 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcdha8Q91Y12 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcdha8Q91Y12 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcdha8Q91Y12 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcdha8Q91Y12 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcdha8Q91Y12 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcdha8Q91Y12 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcdha8Q91Y12 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcdha8Q91Y12 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcdha8Q91Y12 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcdha8Q91Y12 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcdha8Q91Y12 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcdha8Q91Y12 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcdha8Q91Y12 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcdha8Q91Y12 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcdha8Q91Y12 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcdha8Q91Y12 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcdha8Q91Y12 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcdha8Q91Y12 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcdha8Q91Y12 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcdha8Q91Y12 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcdha8Q91Y12 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcdha8Q91Y12 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcdha8Q91Y12 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcdha8Q91Y12 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcdha8Q91Y12 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcdha8Q91Y12 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcdha8Q91Y12 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcdha8Q91Y12 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcdha8Q91Y12 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcdha8Q91Y12 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcdha8Q91Y12 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms