Protein–RNA interactions for Protein: Q91Y06

Pcdhb13, Protocadherin beta 13, mousemouse

Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdhb13Q91Y06 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcdhb13Q91Y06 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcdhb13Q91Y06 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcdhb13Q91Y06 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcdhb13Q91Y06 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcdhb13Q91Y06 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcdhb13Q91Y06 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcdhb13Q91Y06 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcdhb13Q91Y06 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcdhb13Q91Y06 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcdhb13Q91Y06 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcdhb13Q91Y06 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pcdhb13Q91Y06 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pcdhb13Q91Y06 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pcdhb13Q91Y06 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pcdhb13Q91Y06 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pcdhb13Q91Y06 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pcdhb13Q91Y06 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pcdhb13Q91Y06 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pcdhb13Q91Y06 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pcdhb13Q91Y06 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pcdhb13Q91Y06 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pcdhb13Q91Y06 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pcdhb13Q91Y06 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pcdhb13Q91Y06 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pcdhb13Q91Y06 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pcdhb13Q91Y06 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pcdhb13Q91Y06 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pcdhb13Q91Y06 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pcdhb13Q91Y06 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pcdhb13Q91Y06 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pcdhb13Q91Y06 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pcdhb13Q91Y06 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pcdhb13Q91Y06 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pcdhb13Q91Y06 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pcdhb13Q91Y06 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcdhb13Q91Y06 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcdhb13Q91Y06 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcdhb13Q91Y06 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcdhb13Q91Y06 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcdhb13Q91Y06 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcdhb13Q91Y06 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcdhb13Q91Y06 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcdhb13Q91Y06 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcdhb13Q91Y06 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcdhb13Q91Y06 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcdhb13Q91Y06 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcdhb13Q91Y06 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcdhb13Q91Y06 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcdhb13Q91Y06 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcdhb13Q91Y06 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcdhb13Q91Y06 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcdhb13Q91Y06 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcdhb13Q91Y06 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcdhb13Q91Y06 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcdhb13Q91Y06 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcdhb13Q91Y06 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcdhb13Q91Y06 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcdhb13Q91Y06 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcdhb13Q91Y06 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcdhb13Q91Y06 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcdhb13Q91Y06 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcdhb13Q91Y06 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pcdhb13Q91Y06 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pcdhb13Q91Y06 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pcdhb13Q91Y06 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pcdhb13Q91Y06 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pcdhb13Q91Y06 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pcdhb13Q91Y06 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pcdhb13Q91Y06 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pcdhb13Q91Y06 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pcdhb13Q91Y06 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pcdhb13Q91Y06 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pcdhb13Q91Y06 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pcdhb13Q91Y06 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pcdhb13Q91Y06 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pcdhb13Q91Y06 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pcdhb13Q91Y06 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pcdhb13Q91Y06 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pcdhb13Q91Y06 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pcdhb13Q91Y06 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pcdhb13Q91Y06 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pcdhb13Q91Y06 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pcdhb13Q91Y06 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pcdhb13Q91Y06 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pcdhb13Q91Y06 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pcdhb13Q91Y06 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pcdhb13Q91Y06 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Pcdhb13Q91Y06 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pcdhb13Q91Y06 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pcdhb13Q91Y06 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pcdhb13Q91Y06 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pcdhb13Q91Y06 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcdhb13Q91Y06 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcdhb13Q91Y06 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcdhb13Q91Y06 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcdhb13Q91Y06 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcdhb13Q91Y06 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcdhb13Q91Y06 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcdhb13Q91Y06 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms