Protein–RNA interactions for Protein: Q91WL6

Snx11, Sorting nexin-11, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx11Q91WL6 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Snx11Q91WL6 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Snx11Q91WL6 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Snx11Q91WL6 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx11Q91WL6 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx11Q91WL6 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx11Q91WL6 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx11Q91WL6 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx11Q91WL6 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx11Q91WL6 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx11Q91WL6 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx11Q91WL6 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx11Q91WL6 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx11Q91WL6 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx11Q91WL6 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx11Q91WL6 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx11Q91WL6 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx11Q91WL6 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx11Q91WL6 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx11Q91WL6 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx11Q91WL6 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx11Q91WL6 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx11Q91WL6 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx11Q91WL6 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx11Q91WL6 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx11Q91WL6 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx11Q91WL6 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx11Q91WL6 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx11Q91WL6 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx11Q91WL6 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx11Q91WL6 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx11Q91WL6 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx11Q91WL6 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx11Q91WL6 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx11Q91WL6 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx11Q91WL6 Gm19891-201ENSMUST00000189771 303 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx11Q91WL6 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx11Q91WL6 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx11Q91WL6 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx11Q91WL6 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx11Q91WL6 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx11Q91WL6 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx11Q91WL6 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx11Q91WL6 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx11Q91WL6 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx11Q91WL6 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx11Q91WL6 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx11Q91WL6 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx11Q91WL6 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx11Q91WL6 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx11Q91WL6 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx11Q91WL6 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx11Q91WL6 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx11Q91WL6 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx11Q91WL6 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx11Q91WL6 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx11Q91WL6 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx11Q91WL6 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx11Q91WL6 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx11Q91WL6 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx11Q91WL6 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx11Q91WL6 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx11Q91WL6 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx11Q91WL6 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx11Q91WL6 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx11Q91WL6 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx11Q91WL6 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx11Q91WL6 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx11Q91WL6 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx11Q91WL6 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx11Q91WL6 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx11Q91WL6 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx11Q91WL6 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx11Q91WL6 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx11Q91WL6 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx11Q91WL6 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx11Q91WL6 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx11Q91WL6 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx11Q91WL6 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx11Q91WL6 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx11Q91WL6 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx11Q91WL6 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx11Q91WL6 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx11Q91WL6 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx11Q91WL6 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx11Q91WL6 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx11Q91WL6 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx11Q91WL6 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx11Q91WL6 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx11Q91WL6 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx11Q91WL6 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx11Q91WL6 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx11Q91WL6 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx11Q91WL6 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx11Q91WL6 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx11Q91WL6 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx11Q91WL6 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx11Q91WL6 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx11Q91WL6 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx11Q91WL6 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms