Protein–RNA interactions for Protein: Q91W78

Usb1, U6 snRNA phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usb1Q91W78 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usb1Q91W78 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usb1Q91W78 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Usb1Q91W78 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usb1Q91W78 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usb1Q91W78 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usb1Q91W78 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usb1Q91W78 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usb1Q91W78 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usb1Q91W78 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usb1Q91W78 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usb1Q91W78 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usb1Q91W78 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usb1Q91W78 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usb1Q91W78 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usb1Q91W78 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usb1Q91W78 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usb1Q91W78 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usb1Q91W78 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usb1Q91W78 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usb1Q91W78 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Usb1Q91W78 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usb1Q91W78 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usb1Q91W78 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usb1Q91W78 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usb1Q91W78 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usb1Q91W78 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usb1Q91W78 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usb1Q91W78 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usb1Q91W78 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usb1Q91W78 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usb1Q91W78 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usb1Q91W78 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usb1Q91W78 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usb1Q91W78 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usb1Q91W78 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usb1Q91W78 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usb1Q91W78 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usb1Q91W78 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usb1Q91W78 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usb1Q91W78 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usb1Q91W78 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usb1Q91W78 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usb1Q91W78 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usb1Q91W78 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Usb1Q91W78 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usb1Q91W78 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usb1Q91W78 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usb1Q91W78 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usb1Q91W78 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usb1Q91W78 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usb1Q91W78 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Usb1Q91W78 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usb1Q91W78 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usb1Q91W78 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usb1Q91W78 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usb1Q91W78 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usb1Q91W78 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usb1Q91W78 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usb1Q91W78 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usb1Q91W78 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usb1Q91W78 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usb1Q91W78 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usb1Q91W78 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usb1Q91W78 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usb1Q91W78 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usb1Q91W78 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usb1Q91W78 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usb1Q91W78 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usb1Q91W78 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usb1Q91W78 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usb1Q91W78 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usb1Q91W78 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usb1Q91W78 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usb1Q91W78 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usb1Q91W78 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usb1Q91W78 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usb1Q91W78 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usb1Q91W78 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usb1Q91W78 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usb1Q91W78 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Usb1Q91W78 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usb1Q91W78 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usb1Q91W78 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usb1Q91W78 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usb1Q91W78 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usb1Q91W78 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usb1Q91W78 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usb1Q91W78 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usb1Q91W78 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usb1Q91W78 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usb1Q91W78 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usb1Q91W78 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usb1Q91W78 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usb1Q91W78 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usb1Q91W78 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usb1Q91W78 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usb1Q91W78 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usb1Q91W78 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usb1Q91W78 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms