Protein–RNA interactions for Protein: Q91VT1

Nsmce2, E3 SUMO-protein ligase NSE2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsmce2Q91VT1 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nsmce2Q91VT1 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Nsmce2Q91VT1 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Nsmce2Q91VT1 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nsmce2Q91VT1 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nsmce2Q91VT1 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nsmce2Q91VT1 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nsmce2Q91VT1 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nsmce2Q91VT1 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nsmce2Q91VT1 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nsmce2Q91VT1 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nsmce2Q91VT1 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nsmce2Q91VT1 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Nsmce2Q91VT1 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nsmce2Q91VT1 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nsmce2Q91VT1 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nsmce2Q91VT1 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nsmce2Q91VT1 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nsmce2Q91VT1 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nsmce2Q91VT1 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nsmce2Q91VT1 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nsmce2Q91VT1 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nsmce2Q91VT1 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nsmce2Q91VT1 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nsmce2Q91VT1 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nsmce2Q91VT1 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nsmce2Q91VT1 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nsmce2Q91VT1 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Nsmce2Q91VT1 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nsmce2Q91VT1 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nsmce2Q91VT1 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nsmce2Q91VT1 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nsmce2Q91VT1 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nsmce2Q91VT1 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nsmce2Q91VT1 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nsmce2Q91VT1 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nsmce2Q91VT1 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nsmce2Q91VT1 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nsmce2Q91VT1 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nsmce2Q91VT1 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nsmce2Q91VT1 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nsmce2Q91VT1 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nsmce2Q91VT1 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nsmce2Q91VT1 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nsmce2Q91VT1 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nsmce2Q91VT1 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nsmce2Q91VT1 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nsmce2Q91VT1 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nsmce2Q91VT1 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nsmce2Q91VT1 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nsmce2Q91VT1 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nsmce2Q91VT1 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nsmce2Q91VT1 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nsmce2Q91VT1 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nsmce2Q91VT1 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nsmce2Q91VT1 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nsmce2Q91VT1 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nsmce2Q91VT1 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nsmce2Q91VT1 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nsmce2Q91VT1 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nsmce2Q91VT1 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nsmce2Q91VT1 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nsmce2Q91VT1 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nsmce2Q91VT1 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nsmce2Q91VT1 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nsmce2Q91VT1 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nsmce2Q91VT1 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nsmce2Q91VT1 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nsmce2Q91VT1 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nsmce2Q91VT1 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nsmce2Q91VT1 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nsmce2Q91VT1 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nsmce2Q91VT1 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nsmce2Q91VT1 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nsmce2Q91VT1 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nsmce2Q91VT1 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nsmce2Q91VT1 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nsmce2Q91VT1 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nsmce2Q91VT1 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nsmce2Q91VT1 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nsmce2Q91VT1 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nsmce2Q91VT1 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nsmce2Q91VT1 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nsmce2Q91VT1 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nsmce2Q91VT1 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nsmce2Q91VT1 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nsmce2Q91VT1 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nsmce2Q91VT1 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nsmce2Q91VT1 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nsmce2Q91VT1 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nsmce2Q91VT1 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nsmce2Q91VT1 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nsmce2Q91VT1 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nsmce2Q91VT1 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nsmce2Q91VT1 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nsmce2Q91VT1 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nsmce2Q91VT1 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nsmce2Q91VT1 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nsmce2Q91VT1 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nsmce2Q91VT1 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms