Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ5

Mark1, Serine/threonine-protein kinase MARK1, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mark1Q8VHJ5 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mark1Q8VHJ5 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mark1Q8VHJ5 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Mark1Q8VHJ5 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mark1Q8VHJ5 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Mark1Q8VHJ5 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Mark1Q8VHJ5 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mark1Q8VHJ5 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mark1Q8VHJ5 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mark1Q8VHJ5 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mark1Q8VHJ5 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mark1Q8VHJ5 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mark1Q8VHJ5 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mark1Q8VHJ5 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mark1Q8VHJ5 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mark1Q8VHJ5 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mark1Q8VHJ5 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mark1Q8VHJ5 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mark1Q8VHJ5 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Mark1Q8VHJ5 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mark1Q8VHJ5 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mark1Q8VHJ5 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mark1Q8VHJ5 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mark1Q8VHJ5 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mark1Q8VHJ5 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mark1Q8VHJ5 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mark1Q8VHJ5 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mark1Q8VHJ5 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mark1Q8VHJ5 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Mark1Q8VHJ5 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Mark1Q8VHJ5 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mark1Q8VHJ5 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mark1Q8VHJ5 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mark1Q8VHJ5 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mark1Q8VHJ5 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mark1Q8VHJ5 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mark1Q8VHJ5 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mark1Q8VHJ5 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mark1Q8VHJ5 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mark1Q8VHJ5 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mark1Q8VHJ5 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mark1Q8VHJ5 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mark1Q8VHJ5 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mark1Q8VHJ5 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mark1Q8VHJ5 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mark1Q8VHJ5 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mark1Q8VHJ5 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mark1Q8VHJ5 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mark1Q8VHJ5 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mark1Q8VHJ5 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mark1Q8VHJ5 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mark1Q8VHJ5 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mark1Q8VHJ5 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mark1Q8VHJ5 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Mark1Q8VHJ5 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Mark1Q8VHJ5 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mark1Q8VHJ5 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Mark1Q8VHJ5 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mark1Q8VHJ5 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Mark1Q8VHJ5 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mark1Q8VHJ5 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mark1Q8VHJ5 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mark1Q8VHJ5 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mark1Q8VHJ5 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Mark1Q8VHJ5 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mark1Q8VHJ5 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mark1Q8VHJ5 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mark1Q8VHJ5 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mark1Q8VHJ5 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mark1Q8VHJ5 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mark1Q8VHJ5 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mark1Q8VHJ5 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mark1Q8VHJ5 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mark1Q8VHJ5 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mark1Q8VHJ5 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mark1Q8VHJ5 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mark1Q8VHJ5 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mark1Q8VHJ5 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mark1Q8VHJ5 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mark1Q8VHJ5 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mark1Q8VHJ5 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mark1Q8VHJ5 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mark1Q8VHJ5 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mark1Q8VHJ5 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mark1Q8VHJ5 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mark1Q8VHJ5 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mark1Q8VHJ5 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mark1Q8VHJ5 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mark1Q8VHJ5 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mark1Q8VHJ5 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mark1Q8VHJ5 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mark1Q8VHJ5 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mark1Q8VHJ5 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mark1Q8VHJ5 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mark1Q8VHJ5 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mark1Q8VHJ5 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mark1Q8VHJ5 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mark1Q8VHJ5 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mark1Q8VHJ5 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mark1Q8VHJ5 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms