Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEJ3

Dkk4, Dickkopf-related protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk4Q8VEJ3 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Dkk4Q8VEJ3 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Dkk4Q8VEJ3 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Dkk4Q8VEJ3 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Dkk4Q8VEJ3 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Dkk4Q8VEJ3 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Dkk4Q8VEJ3 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Dkk4Q8VEJ3 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Dkk4Q8VEJ3 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Dkk4Q8VEJ3 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Dkk4Q8VEJ3 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Dkk4Q8VEJ3 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Dkk4Q8VEJ3 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Dkk4Q8VEJ3 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Dkk4Q8VEJ3 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Dkk4Q8VEJ3 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Dkk4Q8VEJ3 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Dkk4Q8VEJ3 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Dkk4Q8VEJ3 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Dkk4Q8VEJ3 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Dkk4Q8VEJ3 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Dkk4Q8VEJ3 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Dkk4Q8VEJ3 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Dkk4Q8VEJ3 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Dkk4Q8VEJ3 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Dkk4Q8VEJ3 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Dkk4Q8VEJ3 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Dkk4Q8VEJ3 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Dkk4Q8VEJ3 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Dkk4Q8VEJ3 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Dkk4Q8VEJ3 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Dkk4Q8VEJ3 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Dkk4Q8VEJ3 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Dkk4Q8VEJ3 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Dkk4Q8VEJ3 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Dkk4Q8VEJ3 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Dkk4Q8VEJ3 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Dkk4Q8VEJ3 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Dkk4Q8VEJ3 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Dkk4Q8VEJ3 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Dkk4Q8VEJ3 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Dkk4Q8VEJ3 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Dkk4Q8VEJ3 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Dkk4Q8VEJ3 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Dkk4Q8VEJ3 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Dkk4Q8VEJ3 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Dkk4Q8VEJ3 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Dkk4Q8VEJ3 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Dkk4Q8VEJ3 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Dkk4Q8VEJ3 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Dkk4Q8VEJ3 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Dkk4Q8VEJ3 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Dkk4Q8VEJ3 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Dkk4Q8VEJ3 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Dkk4Q8VEJ3 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Dkk4Q8VEJ3 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Dkk4Q8VEJ3 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Dkk4Q8VEJ3 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Dkk4Q8VEJ3 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Dkk4Q8VEJ3 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Dkk4Q8VEJ3 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Dkk4Q8VEJ3 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Dkk4Q8VEJ3 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Dkk4Q8VEJ3 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Dkk4Q8VEJ3 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Dkk4Q8VEJ3 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Dkk4Q8VEJ3 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Dkk4Q8VEJ3 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Dkk4Q8VEJ3 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Dkk4Q8VEJ3 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Dkk4Q8VEJ3 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Dkk4Q8VEJ3 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Dkk4Q8VEJ3 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Dkk4Q8VEJ3 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Dkk4Q8VEJ3 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Dkk4Q8VEJ3 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Dkk4Q8VEJ3 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Dkk4Q8VEJ3 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Dkk4Q8VEJ3 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Dkk4Q8VEJ3 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Dkk4Q8VEJ3 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Dkk4Q8VEJ3 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Dkk4Q8VEJ3 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Dkk4Q8VEJ3 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Dkk4Q8VEJ3 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Dkk4Q8VEJ3 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Dkk4Q8VEJ3 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Dkk4Q8VEJ3 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Dkk4Q8VEJ3 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Dkk4Q8VEJ3 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Dkk4Q8VEJ3 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Dkk4Q8VEJ3 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Dkk4Q8VEJ3 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Dkk4Q8VEJ3 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Dkk4Q8VEJ3 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Dkk4Q8VEJ3 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Dkk4Q8VEJ3 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Dkk4Q8VEJ3 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Dkk4Q8VEJ3 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Dkk4Q8VEJ3 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms