Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE18

Smg8, Protein SMG8, mousemouse

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Length 991 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Smg8Q8VE18 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smg8Q8VE18 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smg8Q8VE18 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smg8Q8VE18 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smg8Q8VE18 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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Smg8Q8VE18 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smg8Q8VE18 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
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Smg8Q8VE18 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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Smg8Q8VE18 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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Smg8Q8VE18 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Smg8Q8VE18 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
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Smg8Q8VE18 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smg8Q8VE18 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smg8Q8VE18 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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Smg8Q8VE18 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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Smg8Q8VE18 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smg8Q8VE18 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Smg8Q8VE18 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smg8Q8VE18 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Smg8Q8VE18 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smg8Q8VE18 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Smg8Q8VE18 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smg8Q8VE18 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smg8Q8VE18 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smg8Q8VE18 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smg8Q8VE18 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smg8Q8VE18 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smg8Q8VE18 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smg8Q8VE18 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smg8Q8VE18 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smg8Q8VE18 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smg8Q8VE18 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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Smg8Q8VE18 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
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