Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS8

Stx18, Syntaxin-18, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx18Q8VDS8 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stx18Q8VDS8 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stx18Q8VDS8 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stx18Q8VDS8 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stx18Q8VDS8 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Stx18Q8VDS8 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stx18Q8VDS8 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stx18Q8VDS8 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stx18Q8VDS8 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stx18Q8VDS8 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stx18Q8VDS8 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stx18Q8VDS8 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stx18Q8VDS8 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stx18Q8VDS8 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stx18Q8VDS8 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stx18Q8VDS8 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stx18Q8VDS8 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stx18Q8VDS8 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stx18Q8VDS8 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Stx18Q8VDS8 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Stx18Q8VDS8 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Stx18Q8VDS8 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Stx18Q8VDS8 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Stx18Q8VDS8 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Stx18Q8VDS8 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
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Stx18Q8VDS8 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Stx18Q8VDS8 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Stx18Q8VDS8 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Stx18Q8VDS8 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Stx18Q8VDS8 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Stx18Q8VDS8 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Stx18Q8VDS8 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Stx18Q8VDS8 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Stx18Q8VDS8 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Stx18Q8VDS8 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Stx18Q8VDS8 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Stx18Q8VDS8 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Stx18Q8VDS8 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Stx18Q8VDS8 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Stx18Q8VDS8 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stx18Q8VDS8 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stx18Q8VDS8 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stx18Q8VDS8 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stx18Q8VDS8 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stx18Q8VDS8 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stx18Q8VDS8 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stx18Q8VDS8 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stx18Q8VDS8 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stx18Q8VDS8 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stx18Q8VDS8 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stx18Q8VDS8 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stx18Q8VDS8 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stx18Q8VDS8 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stx18Q8VDS8 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stx18Q8VDS8 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stx18Q8VDS8 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stx18Q8VDS8 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stx18Q8VDS8 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Stx18Q8VDS8 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Stx18Q8VDS8 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stx18Q8VDS8 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stx18Q8VDS8 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Stx18Q8VDS8 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stx18Q8VDS8 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stx18Q8VDS8 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stx18Q8VDS8 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stx18Q8VDS8 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stx18Q8VDS8 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stx18Q8VDS8 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stx18Q8VDS8 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stx18Q8VDS8 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stx18Q8VDS8 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stx18Q8VDS8 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stx18Q8VDS8 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stx18Q8VDS8 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stx18Q8VDS8 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Stx18Q8VDS8 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stx18Q8VDS8 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stx18Q8VDS8 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stx18Q8VDS8 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stx18Q8VDS8 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stx18Q8VDS8 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stx18Q8VDS8 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stx18Q8VDS8 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stx18Q8VDS8 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stx18Q8VDS8 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stx18Q8VDS8 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stx18Q8VDS8 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stx18Q8VDS8 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stx18Q8VDS8 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stx18Q8VDS8 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Stx18Q8VDS8 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stx18Q8VDS8 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stx18Q8VDS8 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stx18Q8VDS8 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Stx18Q8VDS8 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stx18Q8VDS8 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stx18Q8VDS8 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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