Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDB9

Slc6a20a, Sodium- and chloride-dependent transporter XTRP3A, mousemouse

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a20aQ8VDB9 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc6a20aQ8VDB9 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc6a20aQ8VDB9 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc6a20aQ8VDB9 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc6a20aQ8VDB9 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc6a20aQ8VDB9 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc6a20aQ8VDB9 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc6a20aQ8VDB9 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc6a20aQ8VDB9 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc6a20aQ8VDB9 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc6a20aQ8VDB9 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc6a20aQ8VDB9 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc6a20aQ8VDB9 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc6a20aQ8VDB9 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc6a20aQ8VDB9 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc6a20aQ8VDB9 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc6a20aQ8VDB9 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc6a20aQ8VDB9 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc6a20aQ8VDB9 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc6a20aQ8VDB9 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc6a20aQ8VDB9 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc6a20aQ8VDB9 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc6a20aQ8VDB9 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc6a20aQ8VDB9 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc6a20aQ8VDB9 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc6a20aQ8VDB9 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc6a20aQ8VDB9 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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Slc6a20aQ8VDB9 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc6a20aQ8VDB9 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc6a20aQ8VDB9 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc6a20aQ8VDB9 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
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Slc6a20aQ8VDB9 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc6a20aQ8VDB9 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc6a20aQ8VDB9 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
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Slc6a20aQ8VDB9 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc6a20aQ8VDB9 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
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Slc6a20aQ8VDB9 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc6a20aQ8VDB9 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc6a20aQ8VDB9 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc6a20aQ8VDB9 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc6a20aQ8VDB9 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc6a20aQ8VDB9 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc6a20aQ8VDB9 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc6a20aQ8VDB9 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc6a20aQ8VDB9 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc6a20aQ8VDB9 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc6a20aQ8VDB9 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc6a20aQ8VDB9 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc6a20aQ8VDB9 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc6a20aQ8VDB9 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Slc6a20aQ8VDB9 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc6a20aQ8VDB9 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc6a20aQ8VDB9 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Slc6a20aQ8VDB9 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc6a20aQ8VDB9 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc6a20aQ8VDB9 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc6a20aQ8VDB9 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc6a20aQ8VDB9 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc6a20aQ8VDB9 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc6a20aQ8VDB9 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc6a20aQ8VDB9 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc6a20aQ8VDB9 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc6a20aQ8VDB9 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc6a20aQ8VDB9 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc6a20aQ8VDB9 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc6a20aQ8VDB9 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc6a20aQ8VDB9 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc6a20aQ8VDB9 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc6a20aQ8VDB9 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc6a20aQ8VDB9 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc6a20aQ8VDB9 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc6a20aQ8VDB9 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc6a20aQ8VDB9 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc6a20aQ8VDB9 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc6a20aQ8VDB9 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc6a20aQ8VDB9 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Slc6a20aQ8VDB9 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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