Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCZ8

Rpusd1, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd1Q8VCZ8 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpusd1Q8VCZ8 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpusd1Q8VCZ8 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpusd1Q8VCZ8 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Rpusd1Q8VCZ8 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Rpusd1Q8VCZ8 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpusd1Q8VCZ8 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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