Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4D5

Trpm8, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm8Q8R4D5 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trpm8Q8R4D5 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trpm8Q8R4D5 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trpm8Q8R4D5 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trpm8Q8R4D5 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trpm8Q8R4D5 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trpm8Q8R4D5 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trpm8Q8R4D5 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trpm8Q8R4D5 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trpm8Q8R4D5 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trpm8Q8R4D5 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Trpm8Q8R4D5 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trpm8Q8R4D5 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trpm8Q8R4D5 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trpm8Q8R4D5 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Trpm8Q8R4D5 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trpm8Q8R4D5 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trpm8Q8R4D5 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trpm8Q8R4D5 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trpm8Q8R4D5 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trpm8Q8R4D5 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trpm8Q8R4D5 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trpm8Q8R4D5 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trpm8Q8R4D5 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trpm8Q8R4D5 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trpm8Q8R4D5 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trpm8Q8R4D5 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trpm8Q8R4D5 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trpm8Q8R4D5 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trpm8Q8R4D5 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trpm8Q8R4D5 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trpm8Q8R4D5 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trpm8Q8R4D5 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trpm8Q8R4D5 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trpm8Q8R4D5 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trpm8Q8R4D5 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Trpm8Q8R4D5 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trpm8Q8R4D5 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trpm8Q8R4D5 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trpm8Q8R4D5 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trpm8Q8R4D5 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trpm8Q8R4D5 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Trpm8Q8R4D5 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trpm8Q8R4D5 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trpm8Q8R4D5 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trpm8Q8R4D5 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trpm8Q8R4D5 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trpm8Q8R4D5 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trpm8Q8R4D5 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Trpm8Q8R4D5 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trpm8Q8R4D5 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trpm8Q8R4D5 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trpm8Q8R4D5 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trpm8Q8R4D5 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trpm8Q8R4D5 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trpm8Q8R4D5 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Trpm8Q8R4D5 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trpm8Q8R4D5 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trpm8Q8R4D5 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trpm8Q8R4D5 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trpm8Q8R4D5 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trpm8Q8R4D5 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trpm8Q8R4D5 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trpm8Q8R4D5 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trpm8Q8R4D5 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trpm8Q8R4D5 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trpm8Q8R4D5 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trpm8Q8R4D5 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trpm8Q8R4D5 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Trpm8Q8R4D5 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trpm8Q8R4D5 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trpm8Q8R4D5 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trpm8Q8R4D5 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trpm8Q8R4D5 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trpm8Q8R4D5 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trpm8Q8R4D5 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trpm8Q8R4D5 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trpm8Q8R4D5 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trpm8Q8R4D5 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trpm8Q8R4D5 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trpm8Q8R4D5 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trpm8Q8R4D5 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trpm8Q8R4D5 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trpm8Q8R4D5 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trpm8Q8R4D5 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trpm8Q8R4D5 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trpm8Q8R4D5 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trpm8Q8R4D5 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trpm8Q8R4D5 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trpm8Q8R4D5 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trpm8Q8R4D5 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trpm8Q8R4D5 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trpm8Q8R4D5 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trpm8Q8R4D5 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Trpm8Q8R4D5 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trpm8Q8R4D5 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trpm8Q8R4D5 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trpm8Q8R4D5 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trpm8Q8R4D5 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trpm8Q8R4D5 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms