Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3P9

Slf1, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slf1Q8R3P9 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slf1Q8R3P9 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slf1Q8R3P9 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slf1Q8R3P9 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slf1Q8R3P9 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slf1Q8R3P9 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slf1Q8R3P9 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slf1Q8R3P9 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slf1Q8R3P9 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slf1Q8R3P9 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slf1Q8R3P9 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slf1Q8R3P9 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Slf1Q8R3P9 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slf1Q8R3P9 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slf1Q8R3P9 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slf1Q8R3P9 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slf1Q8R3P9 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slf1Q8R3P9 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slf1Q8R3P9 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slf1Q8R3P9 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slf1Q8R3P9 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slf1Q8R3P9 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slf1Q8R3P9 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slf1Q8R3P9 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Slf1Q8R3P9 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slf1Q8R3P9 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slf1Q8R3P9 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slf1Q8R3P9 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slf1Q8R3P9 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slf1Q8R3P9 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slf1Q8R3P9 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slf1Q8R3P9 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slf1Q8R3P9 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slf1Q8R3P9 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slf1Q8R3P9 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slf1Q8R3P9 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slf1Q8R3P9 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slf1Q8R3P9 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slf1Q8R3P9 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slf1Q8R3P9 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slf1Q8R3P9 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slf1Q8R3P9 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slf1Q8R3P9 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slf1Q8R3P9 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slf1Q8R3P9 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slf1Q8R3P9 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slf1Q8R3P9 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slf1Q8R3P9 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slf1Q8R3P9 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slf1Q8R3P9 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slf1Q8R3P9 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slf1Q8R3P9 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slf1Q8R3P9 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slf1Q8R3P9 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slf1Q8R3P9 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slf1Q8R3P9 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slf1Q8R3P9 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slf1Q8R3P9 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slf1Q8R3P9 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slf1Q8R3P9 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slf1Q8R3P9 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slf1Q8R3P9 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slf1Q8R3P9 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slf1Q8R3P9 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slf1Q8R3P9 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slf1Q8R3P9 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slf1Q8R3P9 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slf1Q8R3P9 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slf1Q8R3P9 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Slf1Q8R3P9 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slf1Q8R3P9 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slf1Q8R3P9 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slf1Q8R3P9 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slf1Q8R3P9 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slf1Q8R3P9 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slf1Q8R3P9 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slf1Q8R3P9 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slf1Q8R3P9 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slf1Q8R3P9 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slf1Q8R3P9 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slf1Q8R3P9 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slf1Q8R3P9 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slf1Q8R3P9 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slf1Q8R3P9 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slf1Q8R3P9 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slf1Q8R3P9 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slf1Q8R3P9 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slf1Q8R3P9 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slf1Q8R3P9 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slf1Q8R3P9 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slf1Q8R3P9 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Slf1Q8R3P9 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slf1Q8R3P9 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slf1Q8R3P9 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slf1Q8R3P9 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slf1Q8R3P9 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slf1Q8R3P9 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slf1Q8R3P9 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slf1Q8R3P9 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Slf1Q8R3P9 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms