Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0J7

Vps37b, Vacuolar protein sorting-associated protein 37B, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps37bQ8R0J7 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vps37bQ8R0J7 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vps37bQ8R0J7 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Vps37bQ8R0J7 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vps37bQ8R0J7 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vps37bQ8R0J7 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vps37bQ8R0J7 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vps37bQ8R0J7 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vps37bQ8R0J7 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vps37bQ8R0J7 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vps37bQ8R0J7 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vps37bQ8R0J7 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vps37bQ8R0J7 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vps37bQ8R0J7 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vps37bQ8R0J7 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vps37bQ8R0J7 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vps37bQ8R0J7 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vps37bQ8R0J7 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vps37bQ8R0J7 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vps37bQ8R0J7 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vps37bQ8R0J7 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vps37bQ8R0J7 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vps37bQ8R0J7 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Vps37bQ8R0J7 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vps37bQ8R0J7 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vps37bQ8R0J7 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vps37bQ8R0J7 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vps37bQ8R0J7 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vps37bQ8R0J7 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vps37bQ8R0J7 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vps37bQ8R0J7 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vps37bQ8R0J7 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vps37bQ8R0J7 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vps37bQ8R0J7 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vps37bQ8R0J7 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vps37bQ8R0J7 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vps37bQ8R0J7 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vps37bQ8R0J7 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vps37bQ8R0J7 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vps37bQ8R0J7 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vps37bQ8R0J7 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vps37bQ8R0J7 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vps37bQ8R0J7 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Vps37bQ8R0J7 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vps37bQ8R0J7 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vps37bQ8R0J7 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Vps37bQ8R0J7 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vps37bQ8R0J7 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vps37bQ8R0J7 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vps37bQ8R0J7 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vps37bQ8R0J7 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vps37bQ8R0J7 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vps37bQ8R0J7 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vps37bQ8R0J7 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vps37bQ8R0J7 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vps37bQ8R0J7 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vps37bQ8R0J7 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vps37bQ8R0J7 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vps37bQ8R0J7 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vps37bQ8R0J7 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vps37bQ8R0J7 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vps37bQ8R0J7 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vps37bQ8R0J7 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vps37bQ8R0J7 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vps37bQ8R0J7 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vps37bQ8R0J7 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vps37bQ8R0J7 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vps37bQ8R0J7 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vps37bQ8R0J7 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vps37bQ8R0J7 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vps37bQ8R0J7 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vps37bQ8R0J7 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vps37bQ8R0J7 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vps37bQ8R0J7 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vps37bQ8R0J7 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vps37bQ8R0J7 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vps37bQ8R0J7 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vps37bQ8R0J7 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Vps37bQ8R0J7 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vps37bQ8R0J7 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vps37bQ8R0J7 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vps37bQ8R0J7 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vps37bQ8R0J7 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vps37bQ8R0J7 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vps37bQ8R0J7 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vps37bQ8R0J7 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vps37bQ8R0J7 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vps37bQ8R0J7 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vps37bQ8R0J7 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vps37bQ8R0J7 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vps37bQ8R0J7 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vps37bQ8R0J7 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vps37bQ8R0J7 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vps37bQ8R0J7 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vps37bQ8R0J7 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vps37bQ8R0J7 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vps37bQ8R0J7 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vps37bQ8R0J7 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vps37bQ8R0J7 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vps37bQ8R0J7 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms