Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxc12Q8K5B8 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxc12Q8K5B8 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxc12Q8K5B8 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxc12Q8K5B8 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxc12Q8K5B8 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxc12Q8K5B8 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxc12Q8K5B8 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxc12Q8K5B8 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxc12Q8K5B8 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxc12Q8K5B8 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxc12Q8K5B8 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxc12Q8K5B8 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxc12Q8K5B8 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxc12Q8K5B8 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxc12Q8K5B8 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxc12Q8K5B8 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxc12Q8K5B8 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxc12Q8K5B8 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxc12Q8K5B8 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxc12Q8K5B8 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxc12Q8K5B8 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxc12Q8K5B8 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxc12Q8K5B8 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxc12Q8K5B8 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxc12Q8K5B8 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxc12Q8K5B8 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxc12Q8K5B8 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxc12Q8K5B8 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxc12Q8K5B8 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxc12Q8K5B8 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxc12Q8K5B8 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxc12Q8K5B8 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxc12Q8K5B8 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxc12Q8K5B8 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxc12Q8K5B8 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxc12Q8K5B8 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxc12Q8K5B8 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxc12Q8K5B8 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxc12Q8K5B8 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxc12Q8K5B8 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxc12Q8K5B8 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxc12Q8K5B8 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxc12Q8K5B8 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxc12Q8K5B8 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxc12Q8K5B8 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxc12Q8K5B8 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxc12Q8K5B8 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxc12Q8K5B8 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxc12Q8K5B8 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxc12Q8K5B8 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxc12Q8K5B8 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxc12Q8K5B8 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxc12Q8K5B8 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxc12Q8K5B8 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxc12Q8K5B8 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxc12Q8K5B8 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxc12Q8K5B8 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxc12Q8K5B8 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxc12Q8K5B8 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxc12Q8K5B8 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxc12Q8K5B8 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxc12Q8K5B8 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxc12Q8K5B8 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxc12Q8K5B8 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxc12Q8K5B8 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxc12Q8K5B8 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Hoxc12Q8K5B8 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Hoxc12Q8K5B8 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Hoxc12Q8K5B8 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Hoxc12Q8K5B8 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxc12Q8K5B8 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxc12Q8K5B8 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxc12Q8K5B8 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxc12Q8K5B8 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxc12Q8K5B8 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxc12Q8K5B8 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxc12Q8K5B8 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxc12Q8K5B8 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxc12Q8K5B8 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxc12Q8K5B8 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxc12Q8K5B8 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxc12Q8K5B8 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxc12Q8K5B8 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxc12Q8K5B8 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxc12Q8K5B8 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxc12Q8K5B8 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxc12Q8K5B8 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxc12Q8K5B8 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxc12Q8K5B8 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxc12Q8K5B8 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxc12Q8K5B8 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxc12Q8K5B8 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxc12Q8K5B8 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxc12Q8K5B8 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxc12Q8K5B8 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxc12Q8K5B8 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxc12Q8K5B8 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxc12Q8K5B8 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxc12Q8K5B8 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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