Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3G5

Vrk3, Inactive serine/threonine-protein kinase VRK3, mousemouse

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vrk3Q8K3G5 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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