Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ssh3Q8K330 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ssh3Q8K330 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ssh3Q8K330 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ssh3Q8K330 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ssh3Q8K330 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ssh3Q8K330 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ssh3Q8K330 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ssh3Q8K330 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ssh3Q8K330 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ssh3Q8K330 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ssh3Q8K330 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ssh3Q8K330 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ssh3Q8K330 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ssh3Q8K330 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ssh3Q8K330 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ssh3Q8K330 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ssh3Q8K330 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ssh3Q8K330 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ssh3Q8K330 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ssh3Q8K330 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ssh3Q8K330 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ssh3Q8K330 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ssh3Q8K330 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ssh3Q8K330 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ssh3Q8K330 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ssh3Q8K330 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ssh3Q8K330 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ssh3Q8K330 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ssh3Q8K330 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ssh3Q8K330 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ssh3Q8K330 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ssh3Q8K330 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ssh3Q8K330 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ssh3Q8K330 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ssh3Q8K330 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ssh3Q8K330 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ssh3Q8K330 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ssh3Q8K330 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ssh3Q8K330 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ssh3Q8K330 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ssh3Q8K330 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ssh3Q8K330 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ssh3Q8K330 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ssh3Q8K330 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ssh3Q8K330 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ssh3Q8K330 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ssh3Q8K330 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ssh3Q8K330 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ssh3Q8K330 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ssh3Q8K330 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ssh3Q8K330 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ssh3Q8K330 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ssh3Q8K330 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ssh3Q8K330 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ssh3Q8K330 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ssh3Q8K330 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ssh3Q8K330 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ssh3Q8K330 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ssh3Q8K330 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ssh3Q8K330 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssh3Q8K330 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssh3Q8K330 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssh3Q8K330 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssh3Q8K330 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssh3Q8K330 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssh3Q8K330 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssh3Q8K330 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssh3Q8K330 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssh3Q8K330 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssh3Q8K330 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssh3Q8K330 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssh3Q8K330 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssh3Q8K330 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssh3Q8K330 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssh3Q8K330 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssh3Q8K330 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssh3Q8K330 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssh3Q8K330 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssh3Q8K330 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssh3Q8K330 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssh3Q8K330 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssh3Q8K330 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssh3Q8K330 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssh3Q8K330 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssh3Q8K330 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssh3Q8K330 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssh3Q8K330 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ssh3Q8K330 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ssh3Q8K330 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ssh3Q8K330 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ssh3Q8K330 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ssh3Q8K330 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ssh3Q8K330 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ssh3Q8K330 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ssh3Q8K330 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ssh3Q8K330 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ssh3Q8K330 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ssh3Q8K330 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ssh3Q8K330 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms