Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Y9

Ccm2, Cerebral cavernous malformations protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccm2Q8K2Y9 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccm2Q8K2Y9 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccm2Q8K2Y9 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccm2Q8K2Y9 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccm2Q8K2Y9 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccm2Q8K2Y9 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccm2Q8K2Y9 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccm2Q8K2Y9 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccm2Q8K2Y9 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccm2Q8K2Y9 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccm2Q8K2Y9 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccm2Q8K2Y9 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccm2Q8K2Y9 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccm2Q8K2Y9 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccm2Q8K2Y9 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccm2Q8K2Y9 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccm2Q8K2Y9 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccm2Q8K2Y9 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccm2Q8K2Y9 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccm2Q8K2Y9 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccm2Q8K2Y9 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccm2Q8K2Y9 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccm2Q8K2Y9 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccm2Q8K2Y9 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccm2Q8K2Y9 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccm2Q8K2Y9 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccm2Q8K2Y9 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccm2Q8K2Y9 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccm2Q8K2Y9 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccm2Q8K2Y9 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccm2Q8K2Y9 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccm2Q8K2Y9 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccm2Q8K2Y9 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccm2Q8K2Y9 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccm2Q8K2Y9 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccm2Q8K2Y9 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccm2Q8K2Y9 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccm2Q8K2Y9 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccm2Q8K2Y9 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccm2Q8K2Y9 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccm2Q8K2Y9 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccm2Q8K2Y9 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccm2Q8K2Y9 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccm2Q8K2Y9 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccm2Q8K2Y9 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccm2Q8K2Y9 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccm2Q8K2Y9 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccm2Q8K2Y9 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccm2Q8K2Y9 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccm2Q8K2Y9 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccm2Q8K2Y9 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccm2Q8K2Y9 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccm2Q8K2Y9 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccm2Q8K2Y9 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccm2Q8K2Y9 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccm2Q8K2Y9 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccm2Q8K2Y9 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccm2Q8K2Y9 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccm2Q8K2Y9 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccm2Q8K2Y9 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccm2Q8K2Y9 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccm2Q8K2Y9 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccm2Q8K2Y9 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccm2Q8K2Y9 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccm2Q8K2Y9 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccm2Q8K2Y9 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccm2Q8K2Y9 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccm2Q8K2Y9 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccm2Q8K2Y9 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccm2Q8K2Y9 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccm2Q8K2Y9 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccm2Q8K2Y9 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccm2Q8K2Y9 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccm2Q8K2Y9 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccm2Q8K2Y9 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccm2Q8K2Y9 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccm2Q8K2Y9 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccm2Q8K2Y9 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccm2Q8K2Y9 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccm2Q8K2Y9 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccm2Q8K2Y9 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccm2Q8K2Y9 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccm2Q8K2Y9 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccm2Q8K2Y9 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccm2Q8K2Y9 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccm2Q8K2Y9 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccm2Q8K2Y9 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccm2Q8K2Y9 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccm2Q8K2Y9 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccm2Q8K2Y9 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccm2Q8K2Y9 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccm2Q8K2Y9 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccm2Q8K2Y9 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccm2Q8K2Y9 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccm2Q8K2Y9 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccm2Q8K2Y9 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccm2Q8K2Y9 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccm2Q8K2Y9 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccm2Q8K2Y9 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccm2Q8K2Y9 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms