Protein–RNA interactions for Protein: Q8K284

Gtf3c1, General transcription factor 3C polypeptide 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c1Q8K284 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gtf3c1Q8K284 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gtf3c1Q8K284 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gtf3c1Q8K284 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gtf3c1Q8K284 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gtf3c1Q8K284 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gtf3c1Q8K284 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gtf3c1Q8K284 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gtf3c1Q8K284 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gtf3c1Q8K284 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gtf3c1Q8K284 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gtf3c1Q8K284 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gtf3c1Q8K284 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gtf3c1Q8K284 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gtf3c1Q8K284 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gtf3c1Q8K284 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gtf3c1Q8K284 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gtf3c1Q8K284 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gtf3c1Q8K284 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gtf3c1Q8K284 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gtf3c1Q8K284 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gtf3c1Q8K284 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gtf3c1Q8K284 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gtf3c1Q8K284 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gtf3c1Q8K284 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gtf3c1Q8K284 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gtf3c1Q8K284 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gtf3c1Q8K284 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gtf3c1Q8K284 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gtf3c1Q8K284 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gtf3c1Q8K284 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gtf3c1Q8K284 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gtf3c1Q8K284 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gtf3c1Q8K284 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gtf3c1Q8K284 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gtf3c1Q8K284 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gtf3c1Q8K284 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gtf3c1Q8K284 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gtf3c1Q8K284 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gtf3c1Q8K284 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gtf3c1Q8K284 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gtf3c1Q8K284 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gtf3c1Q8K284 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gtf3c1Q8K284 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gtf3c1Q8K284 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gtf3c1Q8K284 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gtf3c1Q8K284 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gtf3c1Q8K284 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gtf3c1Q8K284 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gtf3c1Q8K284 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gtf3c1Q8K284 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gtf3c1Q8K284 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gtf3c1Q8K284 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gtf3c1Q8K284 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtf3c1Q8K284 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtf3c1Q8K284 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtf3c1Q8K284 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtf3c1Q8K284 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtf3c1Q8K284 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtf3c1Q8K284 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtf3c1Q8K284 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtf3c1Q8K284 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtf3c1Q8K284 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtf3c1Q8K284 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtf3c1Q8K284 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtf3c1Q8K284 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtf3c1Q8K284 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtf3c1Q8K284 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtf3c1Q8K284 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtf3c1Q8K284 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtf3c1Q8K284 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtf3c1Q8K284 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtf3c1Q8K284 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtf3c1Q8K284 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtf3c1Q8K284 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtf3c1Q8K284 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtf3c1Q8K284 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtf3c1Q8K284 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtf3c1Q8K284 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtf3c1Q8K284 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtf3c1Q8K284 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtf3c1Q8K284 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtf3c1Q8K284 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtf3c1Q8K284 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gtf3c1Q8K284 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtf3c1Q8K284 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtf3c1Q8K284 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtf3c1Q8K284 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtf3c1Q8K284 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtf3c1Q8K284 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtf3c1Q8K284 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtf3c1Q8K284 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtf3c1Q8K284 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtf3c1Q8K284 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtf3c1Q8K284 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtf3c1Q8K284 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtf3c1Q8K284 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtf3c1Q8K284 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtf3c1Q8K284 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtf3c1Q8K284 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms