Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Abcf3Q8K268 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Abcf3Q8K268 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Abcf3Q8K268 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Abcf3Q8K268 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Abcf3Q8K268 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Abcf3Q8K268 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Abcf3Q8K268 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Abcf3Q8K268 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Abcf3Q8K268 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Abcf3Q8K268 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Abcf3Q8K268 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Abcf3Q8K268 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Abcf3Q8K268 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Abcf3Q8K268 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Abcf3Q8K268 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Abcf3Q8K268 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Abcf3Q8K268 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Abcf3Q8K268 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Abcf3Q8K268 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Abcf3Q8K268 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Abcf3Q8K268 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Abcf3Q8K268 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Abcf3Q8K268 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Abcf3Q8K268 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Abcf3Q8K268 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Abcf3Q8K268 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Abcf3Q8K268 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Abcf3Q8K268 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Abcf3Q8K268 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Abcf3Q8K268 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Abcf3Q8K268 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Abcf3Q8K268 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Abcf3Q8K268 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Abcf3Q8K268 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Abcf3Q8K268 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Abcf3Q8K268 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Abcf3Q8K268 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Abcf3Q8K268 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Abcf3Q8K268 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Abcf3Q8K268 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Abcf3Q8K268 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Abcf3Q8K268 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Abcf3Q8K268 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Abcf3Q8K268 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Abcf3Q8K268 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Abcf3Q8K268 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Abcf3Q8K268 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Abcf3Q8K268 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Abcf3Q8K268 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Abcf3Q8K268 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Abcf3Q8K268 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Abcf3Q8K268 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Abcf3Q8K268 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Abcf3Q8K268 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Abcf3Q8K268 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Abcf3Q8K268 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Abcf3Q8K268 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Abcf3Q8K268 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Abcf3Q8K268 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Abcf3Q8K268 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Abcf3Q8K268 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Abcf3Q8K268 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Abcf3Q8K268 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Abcf3Q8K268 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Abcf3Q8K268 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Abcf3Q8K268 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Abcf3Q8K268 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Abcf3Q8K268 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Abcf3Q8K268 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Abcf3Q8K268 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Abcf3Q8K268 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Abcf3Q8K268 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Abcf3Q8K268 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Abcf3Q8K268 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Abcf3Q8K268 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Abcf3Q8K268 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Abcf3Q8K268 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Abcf3Q8K268 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Abcf3Q8K268 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Abcf3Q8K268 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Abcf3Q8K268 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Abcf3Q8K268 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Abcf3Q8K268 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Abcf3Q8K268 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Abcf3Q8K268 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Abcf3Q8K268 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Abcf3Q8K268 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Abcf3Q8K268 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Abcf3Q8K268 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Abcf3Q8K268 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Abcf3Q8K268 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Abcf3Q8K268 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Abcf3Q8K268 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Abcf3Q8K268 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Abcf3Q8K268 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Abcf3Q8K268 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Abcf3Q8K268 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Abcf3Q8K268 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Abcf3Q8K268 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms