Protein–RNA interactions for Protein: Q8K194

Snrnp27, U4/U6.U5 small nuclear ribonucleoprotein 27 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrnp27Q8K194 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snrnp27Q8K194 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snrnp27Q8K194 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snrnp27Q8K194 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snrnp27Q8K194 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snrnp27Q8K194 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snrnp27Q8K194 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snrnp27Q8K194 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Snrnp27Q8K194 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snrnp27Q8K194 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snrnp27Q8K194 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Snrnp27Q8K194 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snrnp27Q8K194 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snrnp27Q8K194 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snrnp27Q8K194 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snrnp27Q8K194 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snrnp27Q8K194 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snrnp27Q8K194 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snrnp27Q8K194 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snrnp27Q8K194 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snrnp27Q8K194 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snrnp27Q8K194 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snrnp27Q8K194 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snrnp27Q8K194 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snrnp27Q8K194 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snrnp27Q8K194 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snrnp27Q8K194 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snrnp27Q8K194 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snrnp27Q8K194 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Snrnp27Q8K194 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Snrnp27Q8K194 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snrnp27Q8K194 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snrnp27Q8K194 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snrnp27Q8K194 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snrnp27Q8K194 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snrnp27Q8K194 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snrnp27Q8K194 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snrnp27Q8K194 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Snrnp27Q8K194 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snrnp27Q8K194 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snrnp27Q8K194 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snrnp27Q8K194 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snrnp27Q8K194 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snrnp27Q8K194 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snrnp27Q8K194 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snrnp27Q8K194 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snrnp27Q8K194 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snrnp27Q8K194 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snrnp27Q8K194 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Snrnp27Q8K194 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Snrnp27Q8K194 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snrnp27Q8K194 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snrnp27Q8K194 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snrnp27Q8K194 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snrnp27Q8K194 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snrnp27Q8K194 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snrnp27Q8K194 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snrnp27Q8K194 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snrnp27Q8K194 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snrnp27Q8K194 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Snrnp27Q8K194 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snrnp27Q8K194 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snrnp27Q8K194 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snrnp27Q8K194 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snrnp27Q8K194 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snrnp27Q8K194 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snrnp27Q8K194 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snrnp27Q8K194 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snrnp27Q8K194 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snrnp27Q8K194 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snrnp27Q8K194 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snrnp27Q8K194 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snrnp27Q8K194 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snrnp27Q8K194 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Snrnp27Q8K194 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snrnp27Q8K194 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snrnp27Q8K194 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snrnp27Q8K194 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snrnp27Q8K194 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snrnp27Q8K194 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snrnp27Q8K194 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snrnp27Q8K194 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snrnp27Q8K194 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snrnp27Q8K194 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snrnp27Q8K194 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snrnp27Q8K194 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snrnp27Q8K194 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snrnp27Q8K194 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snrnp27Q8K194 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snrnp27Q8K194 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snrnp27Q8K194 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snrnp27Q8K194 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snrnp27Q8K194 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snrnp27Q8K194 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Snrnp27Q8K194 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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