Protein–RNA interactions for Protein: Q8K045

Pkn3, Serine/threonine-protein kinase N3, mousemouse

Predictions only

Length 878 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn3Q8K045 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkn3Q8K045 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkn3Q8K045 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkn3Q8K045 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkn3Q8K045 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkn3Q8K045 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkn3Q8K045 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkn3Q8K045 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkn3Q8K045 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkn3Q8K045 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkn3Q8K045 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkn3Q8K045 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkn3Q8K045 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkn3Q8K045 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkn3Q8K045 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkn3Q8K045 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkn3Q8K045 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkn3Q8K045 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkn3Q8K045 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkn3Q8K045 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkn3Q8K045 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pkn3Q8K045 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pkn3Q8K045 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pkn3Q8K045 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pkn3Q8K045 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pkn3Q8K045 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pkn3Q8K045 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pkn3Q8K045 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pkn3Q8K045 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pkn3Q8K045 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pkn3Q8K045 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pkn3Q8K045 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pkn3Q8K045 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pkn3Q8K045 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pkn3Q8K045 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pkn3Q8K045 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pkn3Q8K045 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Pkn3Q8K045 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pkn3Q8K045 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pkn3Q8K045 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pkn3Q8K045 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pkn3Q8K045 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pkn3Q8K045 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pkn3Q8K045 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pkn3Q8K045 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pkn3Q8K045 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pkn3Q8K045 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pkn3Q8K045 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pkn3Q8K045 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pkn3Q8K045 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pkn3Q8K045 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pkn3Q8K045 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pkn3Q8K045 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pkn3Q8K045 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pkn3Q8K045 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pkn3Q8K045 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Pkn3Q8K045 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pkn3Q8K045 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pkn3Q8K045 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pkn3Q8K045 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pkn3Q8K045 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pkn3Q8K045 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pkn3Q8K045 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pkn3Q8K045 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pkn3Q8K045 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pkn3Q8K045 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pkn3Q8K045 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pkn3Q8K045 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pkn3Q8K045 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pkn3Q8K045 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pkn3Q8K045 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pkn3Q8K045 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pkn3Q8K045 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pkn3Q8K045 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pkn3Q8K045 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pkn3Q8K045 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pkn3Q8K045 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pkn3Q8K045 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pkn3Q8K045 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pkn3Q8K045 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pkn3Q8K045 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pkn3Q8K045 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pkn3Q8K045 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pkn3Q8K045 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pkn3Q8K045 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pkn3Q8K045 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pkn3Q8K045 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pkn3Q8K045 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pkn3Q8K045 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Pkn3Q8K045 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pkn3Q8K045 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Pkn3Q8K045 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Pkn3Q8K045 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pkn3Q8K045 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pkn3Q8K045 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pkn3Q8K045 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pkn3Q8K045 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pkn3Q8K045 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pkn3Q8K045 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pkn3Q8K045 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms