Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZW5

Sh2d5, SH2 domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d5Q8JZW5 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh2d5Q8JZW5 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh2d5Q8JZW5 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh2d5Q8JZW5 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh2d5Q8JZW5 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh2d5Q8JZW5 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh2d5Q8JZW5 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh2d5Q8JZW5 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh2d5Q8JZW5 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh2d5Q8JZW5 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh2d5Q8JZW5 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh2d5Q8JZW5 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh2d5Q8JZW5 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh2d5Q8JZW5 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh2d5Q8JZW5 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sh2d5Q8JZW5 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sh2d5Q8JZW5 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sh2d5Q8JZW5 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sh2d5Q8JZW5 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sh2d5Q8JZW5 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Sh2d5Q8JZW5 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sh2d5Q8JZW5 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sh2d5Q8JZW5 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Sh2d5Q8JZW5 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sh2d5Q8JZW5 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sh2d5Q8JZW5 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sh2d5Q8JZW5 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Sh2d5Q8JZW5 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sh2d5Q8JZW5 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Sh2d5Q8JZW5 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sh2d5Q8JZW5 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sh2d5Q8JZW5 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sh2d5Q8JZW5 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sh2d5Q8JZW5 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sh2d5Q8JZW5 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sh2d5Q8JZW5 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sh2d5Q8JZW5 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sh2d5Q8JZW5 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sh2d5Q8JZW5 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sh2d5Q8JZW5 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sh2d5Q8JZW5 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sh2d5Q8JZW5 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sh2d5Q8JZW5 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Sh2d5Q8JZW5 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sh2d5Q8JZW5 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sh2d5Q8JZW5 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sh2d5Q8JZW5 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sh2d5Q8JZW5 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sh2d5Q8JZW5 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sh2d5Q8JZW5 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Sh2d5Q8JZW5 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sh2d5Q8JZW5 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sh2d5Q8JZW5 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sh2d5Q8JZW5 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sh2d5Q8JZW5 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sh2d5Q8JZW5 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sh2d5Q8JZW5 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sh2d5Q8JZW5 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sh2d5Q8JZW5 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sh2d5Q8JZW5 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sh2d5Q8JZW5 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sh2d5Q8JZW5 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sh2d5Q8JZW5 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sh2d5Q8JZW5 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Sh2d5Q8JZW5 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sh2d5Q8JZW5 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sh2d5Q8JZW5 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sh2d5Q8JZW5 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sh2d5Q8JZW5 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sh2d5Q8JZW5 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Sh2d5Q8JZW5 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sh2d5Q8JZW5 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sh2d5Q8JZW5 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sh2d5Q8JZW5 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sh2d5Q8JZW5 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sh2d5Q8JZW5 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sh2d5Q8JZW5 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sh2d5Q8JZW5 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sh2d5Q8JZW5 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sh2d5Q8JZW5 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sh2d5Q8JZW5 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sh2d5Q8JZW5 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sh2d5Q8JZW5 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sh2d5Q8JZW5 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sh2d5Q8JZW5 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sh2d5Q8JZW5 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sh2d5Q8JZW5 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sh2d5Q8JZW5 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sh2d5Q8JZW5 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sh2d5Q8JZW5 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sh2d5Q8JZW5 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sh2d5Q8JZW5 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sh2d5Q8JZW5 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sh2d5Q8JZW5 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sh2d5Q8JZW5 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sh2d5Q8JZW5 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sh2d5Q8JZW5 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Sh2d5Q8JZW5 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sh2d5Q8JZW5 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sh2d5Q8JZW5 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms