Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ78

Znf628, Zinc finger protein 628, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf628Q8CJ78 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Znf628Q8CJ78 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Znf628Q8CJ78 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Znf628Q8CJ78 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Znf628Q8CJ78 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Znf628Q8CJ78 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Znf628Q8CJ78 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Znf628Q8CJ78 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Znf628Q8CJ78 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Znf628Q8CJ78 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Znf628Q8CJ78 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Znf628Q8CJ78 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Znf628Q8CJ78 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Znf628Q8CJ78 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Znf628Q8CJ78 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Znf628Q8CJ78 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Znf628Q8CJ78 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Znf628Q8CJ78 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Znf628Q8CJ78 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Znf628Q8CJ78 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Znf628Q8CJ78 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Znf628Q8CJ78 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Znf628Q8CJ78 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Znf628Q8CJ78 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Znf628Q8CJ78 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Znf628Q8CJ78 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Znf628Q8CJ78 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Znf628Q8CJ78 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Znf628Q8CJ78 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Znf628Q8CJ78 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Znf628Q8CJ78 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Znf628Q8CJ78 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Znf628Q8CJ78 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Znf628Q8CJ78 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Znf628Q8CJ78 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Znf628Q8CJ78 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Znf628Q8CJ78 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Znf628Q8CJ78 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Znf628Q8CJ78 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Znf628Q8CJ78 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Znf628Q8CJ78 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Znf628Q8CJ78 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Znf628Q8CJ78 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Znf628Q8CJ78 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Znf628Q8CJ78 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Znf628Q8CJ78 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Znf628Q8CJ78 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Znf628Q8CJ78 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Znf628Q8CJ78 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Znf628Q8CJ78 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Znf628Q8CJ78 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Znf628Q8CJ78 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Znf628Q8CJ78 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Znf628Q8CJ78 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Znf628Q8CJ78 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Znf628Q8CJ78 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Znf628Q8CJ78 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Znf628Q8CJ78 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Znf628Q8CJ78 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Znf628Q8CJ78 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Znf628Q8CJ78 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Znf628Q8CJ78 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Znf628Q8CJ78 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Znf628Q8CJ78 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Znf628Q8CJ78 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Znf628Q8CJ78 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Znf628Q8CJ78 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Znf628Q8CJ78 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Znf628Q8CJ78 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Znf628Q8CJ78 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Znf628Q8CJ78 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Znf628Q8CJ78 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Znf628Q8CJ78 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Znf628Q8CJ78 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Znf628Q8CJ78 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Znf628Q8CJ78 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Znf628Q8CJ78 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Znf628Q8CJ78 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Znf628Q8CJ78 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Znf628Q8CJ78 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Znf628Q8CJ78 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Znf628Q8CJ78 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Znf628Q8CJ78 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Znf628Q8CJ78 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Znf628Q8CJ78 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Znf628Q8CJ78 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Znf628Q8CJ78 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Znf628Q8CJ78 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Znf628Q8CJ78 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Znf628Q8CJ78 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Znf628Q8CJ78 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Znf628Q8CJ78 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Znf628Q8CJ78 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Znf628Q8CJ78 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Znf628Q8CJ78 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Znf628Q8CJ78 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Znf628Q8CJ78 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Znf628Q8CJ78 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Znf628Q8CJ78 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Znf628Q8CJ78 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms