Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIW5

Twnk, Twinkle protein, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TwnkQ8CIW5 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TwnkQ8CIW5 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TwnkQ8CIW5 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TwnkQ8CIW5 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TwnkQ8CIW5 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TwnkQ8CIW5 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TwnkQ8CIW5 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TwnkQ8CIW5 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TwnkQ8CIW5 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TwnkQ8CIW5 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TwnkQ8CIW5 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TwnkQ8CIW5 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TwnkQ8CIW5 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TwnkQ8CIW5 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TwnkQ8CIW5 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TwnkQ8CIW5 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TwnkQ8CIW5 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TwnkQ8CIW5 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TwnkQ8CIW5 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TwnkQ8CIW5 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TwnkQ8CIW5 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TwnkQ8CIW5 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TwnkQ8CIW5 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TwnkQ8CIW5 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TwnkQ8CIW5 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TwnkQ8CIW5 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TwnkQ8CIW5 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TwnkQ8CIW5 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TwnkQ8CIW5 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TwnkQ8CIW5 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TwnkQ8CIW5 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TwnkQ8CIW5 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TwnkQ8CIW5 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TwnkQ8CIW5 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TwnkQ8CIW5 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TwnkQ8CIW5 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TwnkQ8CIW5 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TwnkQ8CIW5 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TwnkQ8CIW5 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TwnkQ8CIW5 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TwnkQ8CIW5 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TwnkQ8CIW5 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TwnkQ8CIW5 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TwnkQ8CIW5 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TwnkQ8CIW5 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TwnkQ8CIW5 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TwnkQ8CIW5 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TwnkQ8CIW5 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TwnkQ8CIW5 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TwnkQ8CIW5 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
TwnkQ8CIW5 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
TwnkQ8CIW5 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
TwnkQ8CIW5 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TwnkQ8CIW5 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TwnkQ8CIW5 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TwnkQ8CIW5 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TwnkQ8CIW5 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TwnkQ8CIW5 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TwnkQ8CIW5 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TwnkQ8CIW5 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TwnkQ8CIW5 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TwnkQ8CIW5 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TwnkQ8CIW5 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TwnkQ8CIW5 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TwnkQ8CIW5 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TwnkQ8CIW5 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TwnkQ8CIW5 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TwnkQ8CIW5 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TwnkQ8CIW5 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TwnkQ8CIW5 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TwnkQ8CIW5 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TwnkQ8CIW5 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TwnkQ8CIW5 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TwnkQ8CIW5 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TwnkQ8CIW5 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TwnkQ8CIW5 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TwnkQ8CIW5 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TwnkQ8CIW5 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TwnkQ8CIW5 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TwnkQ8CIW5 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TwnkQ8CIW5 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TwnkQ8CIW5 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TwnkQ8CIW5 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TwnkQ8CIW5 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TwnkQ8CIW5 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TwnkQ8CIW5 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TwnkQ8CIW5 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TwnkQ8CIW5 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TwnkQ8CIW5 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TwnkQ8CIW5 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TwnkQ8CIW5 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TwnkQ8CIW5 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TwnkQ8CIW5 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TwnkQ8CIW5 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TwnkQ8CIW5 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TwnkQ8CIW5 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TwnkQ8CIW5 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TwnkQ8CIW5 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TwnkQ8CIW5 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TwnkQ8CIW5 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms