Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGK6

Ifnl3, Interferon lambda-3, mousemouse

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Length 193 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnl3Q8CGK6 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifnl3Q8CGK6 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifnl3Q8CGK6 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifnl3Q8CGK6 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifnl3Q8CGK6 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifnl3Q8CGK6 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifnl3Q8CGK6 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifnl3Q8CGK6 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifnl3Q8CGK6 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifnl3Q8CGK6 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifnl3Q8CGK6 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifnl3Q8CGK6 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifnl3Q8CGK6 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifnl3Q8CGK6 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifnl3Q8CGK6 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifnl3Q8CGK6 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Ifnl3Q8CGK6 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifnl3Q8CGK6 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifnl3Q8CGK6 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifnl3Q8CGK6 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifnl3Q8CGK6 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifnl3Q8CGK6 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifnl3Q8CGK6 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifnl3Q8CGK6 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifnl3Q8CGK6 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifnl3Q8CGK6 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifnl3Q8CGK6 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifnl3Q8CGK6 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifnl3Q8CGK6 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifnl3Q8CGK6 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifnl3Q8CGK6 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifnl3Q8CGK6 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifnl3Q8CGK6 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifnl3Q8CGK6 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifnl3Q8CGK6 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Ifnl3Q8CGK6 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifnl3Q8CGK6 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Ifnl3Q8CGK6 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifnl3Q8CGK6 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifnl3Q8CGK6 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifnl3Q8CGK6 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifnl3Q8CGK6 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifnl3Q8CGK6 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifnl3Q8CGK6 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifnl3Q8CGK6 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifnl3Q8CGK6 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Ifnl3Q8CGK6 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifnl3Q8CGK6 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Ifnl3Q8CGK6 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Ifnl3Q8CGK6 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Ifnl3Q8CGK6 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Ifnl3Q8CGK6 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifnl3Q8CGK6 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifnl3Q8CGK6 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifnl3Q8CGK6 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifnl3Q8CGK6 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifnl3Q8CGK6 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Ifnl3Q8CGK6 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Ifnl3Q8CGK6 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifnl3Q8CGK6 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifnl3Q8CGK6 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifnl3Q8CGK6 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifnl3Q8CGK6 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifnl3Q8CGK6 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifnl3Q8CGK6 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifnl3Q8CGK6 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifnl3Q8CGK6 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifnl3Q8CGK6 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifnl3Q8CGK6 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifnl3Q8CGK6 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifnl3Q8CGK6 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifnl3Q8CGK6 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms