Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hpf1Q8CFE2 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hpf1Q8CFE2 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hpf1Q8CFE2 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hpf1Q8CFE2 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Hpf1Q8CFE2 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hpf1Q8CFE2 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hpf1Q8CFE2 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hpf1Q8CFE2 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hpf1Q8CFE2 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hpf1Q8CFE2 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hpf1Q8CFE2 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hpf1Q8CFE2 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hpf1Q8CFE2 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hpf1Q8CFE2 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hpf1Q8CFE2 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hpf1Q8CFE2 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hpf1Q8CFE2 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hpf1Q8CFE2 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hpf1Q8CFE2 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hpf1Q8CFE2 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hpf1Q8CFE2 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hpf1Q8CFE2 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Hpf1Q8CFE2 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hpf1Q8CFE2 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hpf1Q8CFE2 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hpf1Q8CFE2 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hpf1Q8CFE2 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hpf1Q8CFE2 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hpf1Q8CFE2 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hpf1Q8CFE2 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hpf1Q8CFE2 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hpf1Q8CFE2 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hpf1Q8CFE2 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hpf1Q8CFE2 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hpf1Q8CFE2 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hpf1Q8CFE2 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hpf1Q8CFE2 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hpf1Q8CFE2 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hpf1Q8CFE2 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hpf1Q8CFE2 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hpf1Q8CFE2 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hpf1Q8CFE2 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hpf1Q8CFE2 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hpf1Q8CFE2 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hpf1Q8CFE2 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Hpf1Q8CFE2 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hpf1Q8CFE2 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hpf1Q8CFE2 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Hpf1Q8CFE2 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Hpf1Q8CFE2 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hpf1Q8CFE2 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hpf1Q8CFE2 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Hpf1Q8CFE2 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hpf1Q8CFE2 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hpf1Q8CFE2 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hpf1Q8CFE2 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hpf1Q8CFE2 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hpf1Q8CFE2 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hpf1Q8CFE2 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hpf1Q8CFE2 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hpf1Q8CFE2 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hpf1Q8CFE2 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hpf1Q8CFE2 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hpf1Q8CFE2 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hpf1Q8CFE2 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hpf1Q8CFE2 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hpf1Q8CFE2 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hpf1Q8CFE2 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hpf1Q8CFE2 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hpf1Q8CFE2 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hpf1Q8CFE2 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hpf1Q8CFE2 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hpf1Q8CFE2 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hpf1Q8CFE2 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hpf1Q8CFE2 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hpf1Q8CFE2 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hpf1Q8CFE2 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hpf1Q8CFE2 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Hpf1Q8CFE2 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hpf1Q8CFE2 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Hpf1Q8CFE2 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hpf1Q8CFE2 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Hpf1Q8CFE2 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hpf1Q8CFE2 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hpf1Q8CFE2 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hpf1Q8CFE2 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hpf1Q8CFE2 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hpf1Q8CFE2 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hpf1Q8CFE2 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hpf1Q8CFE2 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hpf1Q8CFE2 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hpf1Q8CFE2 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hpf1Q8CFE2 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hpf1Q8CFE2 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hpf1Q8CFE2 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hpf1Q8CFE2 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hpf1Q8CFE2 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hpf1Q8CFE2 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hpf1Q8CFE2 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms