Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4

Snx8, Sorting nexin-8, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx8Q8CFD4 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx8Q8CFD4 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx8Q8CFD4 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx8Q8CFD4 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx8Q8CFD4 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx8Q8CFD4 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx8Q8CFD4 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx8Q8CFD4 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx8Q8CFD4 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx8Q8CFD4 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx8Q8CFD4 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx8Q8CFD4 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx8Q8CFD4 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx8Q8CFD4 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx8Q8CFD4 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx8Q8CFD4 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx8Q8CFD4 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx8Q8CFD4 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx8Q8CFD4 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx8Q8CFD4 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx8Q8CFD4 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx8Q8CFD4 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx8Q8CFD4 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx8Q8CFD4 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx8Q8CFD4 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx8Q8CFD4 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx8Q8CFD4 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx8Q8CFD4 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx8Q8CFD4 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx8Q8CFD4 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx8Q8CFD4 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx8Q8CFD4 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx8Q8CFD4 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx8Q8CFD4 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx8Q8CFD4 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx8Q8CFD4 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx8Q8CFD4 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx8Q8CFD4 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx8Q8CFD4 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx8Q8CFD4 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx8Q8CFD4 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx8Q8CFD4 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx8Q8CFD4 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx8Q8CFD4 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx8Q8CFD4 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx8Q8CFD4 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx8Q8CFD4 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx8Q8CFD4 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx8Q8CFD4 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx8Q8CFD4 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx8Q8CFD4 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx8Q8CFD4 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx8Q8CFD4 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx8Q8CFD4 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx8Q8CFD4 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx8Q8CFD4 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx8Q8CFD4 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx8Q8CFD4 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx8Q8CFD4 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx8Q8CFD4 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx8Q8CFD4 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx8Q8CFD4 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx8Q8CFD4 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx8Q8CFD4 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx8Q8CFD4 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx8Q8CFD4 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx8Q8CFD4 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx8Q8CFD4 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx8Q8CFD4 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx8Q8CFD4 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx8Q8CFD4 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx8Q8CFD4 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx8Q8CFD4 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx8Q8CFD4 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx8Q8CFD4 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx8Q8CFD4 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx8Q8CFD4 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx8Q8CFD4 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx8Q8CFD4 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx8Q8CFD4 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx8Q8CFD4 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx8Q8CFD4 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx8Q8CFD4 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx8Q8CFD4 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx8Q8CFD4 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx8Q8CFD4 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx8Q8CFD4 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx8Q8CFD4 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx8Q8CFD4 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx8Q8CFD4 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx8Q8CFD4 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx8Q8CFD4 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx8Q8CFD4 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx8Q8CFD4 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx8Q8CFD4 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx8Q8CFD4 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx8Q8CFD4 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx8Q8CFD4 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx8Q8CFD4 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx8Q8CFD4 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms