Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdkl1Q8CEQ0 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdkl1Q8CEQ0 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdkl1Q8CEQ0 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdkl1Q8CEQ0 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdkl1Q8CEQ0 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdkl1Q8CEQ0 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdkl1Q8CEQ0 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdkl1Q8CEQ0 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdkl1Q8CEQ0 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdkl1Q8CEQ0 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdkl1Q8CEQ0 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdkl1Q8CEQ0 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdkl1Q8CEQ0 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdkl1Q8CEQ0 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdkl1Q8CEQ0 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdkl1Q8CEQ0 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdkl1Q8CEQ0 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdkl1Q8CEQ0 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdkl1Q8CEQ0 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdkl1Q8CEQ0 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdkl1Q8CEQ0 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdkl1Q8CEQ0 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdkl1Q8CEQ0 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdkl1Q8CEQ0 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdkl1Q8CEQ0 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdkl1Q8CEQ0 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdkl1Q8CEQ0 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdkl1Q8CEQ0 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdkl1Q8CEQ0 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdkl1Q8CEQ0 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdkl1Q8CEQ0 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdkl1Q8CEQ0 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdkl1Q8CEQ0 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdkl1Q8CEQ0 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdkl1Q8CEQ0 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdkl1Q8CEQ0 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdkl1Q8CEQ0 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdkl1Q8CEQ0 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdkl1Q8CEQ0 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdkl1Q8CEQ0 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdkl1Q8CEQ0 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdkl1Q8CEQ0 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdkl1Q8CEQ0 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdkl1Q8CEQ0 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdkl1Q8CEQ0 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdkl1Q8CEQ0 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdkl1Q8CEQ0 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdkl1Q8CEQ0 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdkl1Q8CEQ0 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdkl1Q8CEQ0 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdkl1Q8CEQ0 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdkl1Q8CEQ0 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms