Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE13

Ccdc17, Coiled-coil domain-containing protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc17Q8CE13 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc17Q8CE13 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc17Q8CE13 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc17Q8CE13 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc17Q8CE13 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc17Q8CE13 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc17Q8CE13 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc17Q8CE13 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc17Q8CE13 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc17Q8CE13 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc17Q8CE13 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc17Q8CE13 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc17Q8CE13 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc17Q8CE13 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc17Q8CE13 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc17Q8CE13 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc17Q8CE13 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc17Q8CE13 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc17Q8CE13 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc17Q8CE13 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc17Q8CE13 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc17Q8CE13 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc17Q8CE13 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc17Q8CE13 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc17Q8CE13 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc17Q8CE13 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc17Q8CE13 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc17Q8CE13 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc17Q8CE13 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc17Q8CE13 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc17Q8CE13 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc17Q8CE13 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc17Q8CE13 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc17Q8CE13 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc17Q8CE13 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc17Q8CE13 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc17Q8CE13 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc17Q8CE13 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc17Q8CE13 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc17Q8CE13 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc17Q8CE13 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc17Q8CE13 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc17Q8CE13 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc17Q8CE13 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc17Q8CE13 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc17Q8CE13 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc17Q8CE13 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc17Q8CE13 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc17Q8CE13 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc17Q8CE13 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc17Q8CE13 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc17Q8CE13 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc17Q8CE13 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc17Q8CE13 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc17Q8CE13 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc17Q8CE13 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc17Q8CE13 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc17Q8CE13 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc17Q8CE13 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc17Q8CE13 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc17Q8CE13 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc17Q8CE13 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc17Q8CE13 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc17Q8CE13 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc17Q8CE13 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc17Q8CE13 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc17Q8CE13 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc17Q8CE13 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc17Q8CE13 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc17Q8CE13 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc17Q8CE13 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc17Q8CE13 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc17Q8CE13 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc17Q8CE13 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc17Q8CE13 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc17Q8CE13 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc17Q8CE13 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc17Q8CE13 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc17Q8CE13 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc17Q8CE13 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc17Q8CE13 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc17Q8CE13 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc17Q8CE13 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc17Q8CE13 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc17Q8CE13 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc17Q8CE13 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc17Q8CE13 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc17Q8CE13 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc17Q8CE13 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc17Q8CE13 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc17Q8CE13 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc17Q8CE13 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc17Q8CE13 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc17Q8CE13 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc17Q8CE13 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc17Q8CE13 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc17Q8CE13 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc17Q8CE13 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc17Q8CE13 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc17Q8CE13 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms