Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCI5

Rybp, RING1 and YY1-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RybpQ8CCI5 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RybpQ8CCI5 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RybpQ8CCI5 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RybpQ8CCI5 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
RybpQ8CCI5 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RybpQ8CCI5 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RybpQ8CCI5 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RybpQ8CCI5 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RybpQ8CCI5 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
RybpQ8CCI5 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RybpQ8CCI5 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RybpQ8CCI5 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RybpQ8CCI5 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RybpQ8CCI5 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RybpQ8CCI5 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
RybpQ8CCI5 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RybpQ8CCI5 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RybpQ8CCI5 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RybpQ8CCI5 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RybpQ8CCI5 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RybpQ8CCI5 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RybpQ8CCI5 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RybpQ8CCI5 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RybpQ8CCI5 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RybpQ8CCI5 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RybpQ8CCI5 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RybpQ8CCI5 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
RybpQ8CCI5 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RybpQ8CCI5 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RybpQ8CCI5 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RybpQ8CCI5 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RybpQ8CCI5 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RybpQ8CCI5 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RybpQ8CCI5 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RybpQ8CCI5 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RybpQ8CCI5 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RybpQ8CCI5 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RybpQ8CCI5 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
RybpQ8CCI5 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
RybpQ8CCI5 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RybpQ8CCI5 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RybpQ8CCI5 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
RybpQ8CCI5 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RybpQ8CCI5 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RybpQ8CCI5 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RybpQ8CCI5 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RybpQ8CCI5 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RybpQ8CCI5 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RybpQ8CCI5 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RybpQ8CCI5 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RybpQ8CCI5 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RybpQ8CCI5 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RybpQ8CCI5 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RybpQ8CCI5 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RybpQ8CCI5 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RybpQ8CCI5 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RybpQ8CCI5 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RybpQ8CCI5 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RybpQ8CCI5 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RybpQ8CCI5 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RybpQ8CCI5 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RybpQ8CCI5 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RybpQ8CCI5 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RybpQ8CCI5 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RybpQ8CCI5 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RybpQ8CCI5 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RybpQ8CCI5 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RybpQ8CCI5 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RybpQ8CCI5 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RybpQ8CCI5 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RybpQ8CCI5 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RybpQ8CCI5 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
RybpQ8CCI5 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RybpQ8CCI5 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RybpQ8CCI5 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RybpQ8CCI5 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RybpQ8CCI5 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RybpQ8CCI5 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RybpQ8CCI5 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RybpQ8CCI5 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RybpQ8CCI5 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RybpQ8CCI5 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RybpQ8CCI5 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RybpQ8CCI5 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RybpQ8CCI5 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RybpQ8CCI5 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RybpQ8CCI5 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
RybpQ8CCI5 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RybpQ8CCI5 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RybpQ8CCI5 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RybpQ8CCI5 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RybpQ8CCI5 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RybpQ8CCI5 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RybpQ8CCI5 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
RybpQ8CCI5 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RybpQ8CCI5 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RybpQ8CCI5 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RybpQ8CCI5 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RybpQ8CCI5 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RybpQ8CCI5 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms