Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nhlrc3Q8CCH2 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nhlrc3Q8CCH2 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nhlrc3Q8CCH2 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nhlrc3Q8CCH2 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nhlrc3Q8CCH2 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nhlrc3Q8CCH2 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nhlrc3Q8CCH2 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nhlrc3Q8CCH2 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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