Protein–RNA interactions for Protein: Q8CC35

Synpo, Synaptopodin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 929 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynpoQ8CC35 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SynpoQ8CC35 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SynpoQ8CC35 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SynpoQ8CC35 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SynpoQ8CC35 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SynpoQ8CC35 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SynpoQ8CC35 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SynpoQ8CC35 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SynpoQ8CC35 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SynpoQ8CC35 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SynpoQ8CC35 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SynpoQ8CC35 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SynpoQ8CC35 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SynpoQ8CC35 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SynpoQ8CC35 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SynpoQ8CC35 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SynpoQ8CC35 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SynpoQ8CC35 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SynpoQ8CC35 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SynpoQ8CC35 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SynpoQ8CC35 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SynpoQ8CC35 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SynpoQ8CC35 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SynpoQ8CC35 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SynpoQ8CC35 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SynpoQ8CC35 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SynpoQ8CC35 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SynpoQ8CC35 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SynpoQ8CC35 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SynpoQ8CC35 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SynpoQ8CC35 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SynpoQ8CC35 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SynpoQ8CC35 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SynpoQ8CC35 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SynpoQ8CC35 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SynpoQ8CC35 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SynpoQ8CC35 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SynpoQ8CC35 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SynpoQ8CC35 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SynpoQ8CC35 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SynpoQ8CC35 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SynpoQ8CC35 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SynpoQ8CC35 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SynpoQ8CC35 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SynpoQ8CC35 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SynpoQ8CC35 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SynpoQ8CC35 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SynpoQ8CC35 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SynpoQ8CC35 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SynpoQ8CC35 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SynpoQ8CC35 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SynpoQ8CC35 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SynpoQ8CC35 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SynpoQ8CC35 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SynpoQ8CC35 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SynpoQ8CC35 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SynpoQ8CC35 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SynpoQ8CC35 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SynpoQ8CC35 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SynpoQ8CC35 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SynpoQ8CC35 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SynpoQ8CC35 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SynpoQ8CC35 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SynpoQ8CC35 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SynpoQ8CC35 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SynpoQ8CC35 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SynpoQ8CC35 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SynpoQ8CC35 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SynpoQ8CC35 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SynpoQ8CC35 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SynpoQ8CC35 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SynpoQ8CC35 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SynpoQ8CC35 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SynpoQ8CC35 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SynpoQ8CC35 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SynpoQ8CC35 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SynpoQ8CC35 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SynpoQ8CC35 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SynpoQ8CC35 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SynpoQ8CC35 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SynpoQ8CC35 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SynpoQ8CC35 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SynpoQ8CC35 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SynpoQ8CC35 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SynpoQ8CC35 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SynpoQ8CC35 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SynpoQ8CC35 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SynpoQ8CC35 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SynpoQ8CC35 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SynpoQ8CC35 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SynpoQ8CC35 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SynpoQ8CC35 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SynpoQ8CC35 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SynpoQ8CC35 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SynpoQ8CC35 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SynpoQ8CC35 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SynpoQ8CC35 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SynpoQ8CC35 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SynpoQ8CC35 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SynpoQ8CC35 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.6 ms