Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBA2

Slfn5, Schlafen family member 5, mousemouse

Predictions only

Length 884 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn5Q8CBA2 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Slfn5Q8CBA2 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Slfn5Q8CBA2 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slfn5Q8CBA2 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slfn5Q8CBA2 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slfn5Q8CBA2 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slfn5Q8CBA2 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slfn5Q8CBA2 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slfn5Q8CBA2 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slfn5Q8CBA2 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slfn5Q8CBA2 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slfn5Q8CBA2 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slfn5Q8CBA2 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slfn5Q8CBA2 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slfn5Q8CBA2 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slfn5Q8CBA2 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slfn5Q8CBA2 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slfn5Q8CBA2 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slfn5Q8CBA2 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slfn5Q8CBA2 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slfn5Q8CBA2 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slfn5Q8CBA2 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slfn5Q8CBA2 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slfn5Q8CBA2 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slfn5Q8CBA2 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slfn5Q8CBA2 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Slfn5Q8CBA2 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slfn5Q8CBA2 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slfn5Q8CBA2 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slfn5Q8CBA2 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slfn5Q8CBA2 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slfn5Q8CBA2 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slfn5Q8CBA2 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slfn5Q8CBA2 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slfn5Q8CBA2 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slfn5Q8CBA2 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slfn5Q8CBA2 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slfn5Q8CBA2 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slfn5Q8CBA2 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slfn5Q8CBA2 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slfn5Q8CBA2 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slfn5Q8CBA2 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slfn5Q8CBA2 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slfn5Q8CBA2 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slfn5Q8CBA2 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slfn5Q8CBA2 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slfn5Q8CBA2 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slfn5Q8CBA2 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slfn5Q8CBA2 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slfn5Q8CBA2 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slfn5Q8CBA2 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slfn5Q8CBA2 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slfn5Q8CBA2 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slfn5Q8CBA2 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slfn5Q8CBA2 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slfn5Q8CBA2 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slfn5Q8CBA2 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slfn5Q8CBA2 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slfn5Q8CBA2 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slfn5Q8CBA2 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slfn5Q8CBA2 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slfn5Q8CBA2 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slfn5Q8CBA2 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slfn5Q8CBA2 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slfn5Q8CBA2 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slfn5Q8CBA2 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slfn5Q8CBA2 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slfn5Q8CBA2 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slfn5Q8CBA2 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slfn5Q8CBA2 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slfn5Q8CBA2 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slfn5Q8CBA2 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slfn5Q8CBA2 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slfn5Q8CBA2 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slfn5Q8CBA2 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slfn5Q8CBA2 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slfn5Q8CBA2 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slfn5Q8CBA2 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slfn5Q8CBA2 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slfn5Q8CBA2 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slfn5Q8CBA2 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Slfn5Q8CBA2 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slfn5Q8CBA2 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Slfn5Q8CBA2 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Slfn5Q8CBA2 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Slfn5Q8CBA2 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slfn5Q8CBA2 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slfn5Q8CBA2 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slfn5Q8CBA2 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slfn5Q8CBA2 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slfn5Q8CBA2 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slfn5Q8CBA2 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Slfn5Q8CBA2 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slfn5Q8CBA2 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slfn5Q8CBA2 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slfn5Q8CBA2 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slfn5Q8CBA2 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slfn5Q8CBA2 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slfn5Q8CBA2 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slfn5Q8CBA2 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms