Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7W7

Dclre1b, 5' exonuclease Apollo, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dclre1bQ8C7W7 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dclre1bQ8C7W7 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dclre1bQ8C7W7 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dclre1bQ8C7W7 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dclre1bQ8C7W7 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dclre1bQ8C7W7 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dclre1bQ8C7W7 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dclre1bQ8C7W7 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Dclre1bQ8C7W7 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dclre1bQ8C7W7 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dclre1bQ8C7W7 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dclre1bQ8C7W7 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dclre1bQ8C7W7 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Dclre1bQ8C7W7 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dclre1bQ8C7W7 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dclre1bQ8C7W7 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dclre1bQ8C7W7 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dclre1bQ8C7W7 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dclre1bQ8C7W7 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dclre1bQ8C7W7 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dclre1bQ8C7W7 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Dclre1bQ8C7W7 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Dclre1bQ8C7W7 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dclre1bQ8C7W7 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dclre1bQ8C7W7 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dclre1bQ8C7W7 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dclre1bQ8C7W7 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dclre1bQ8C7W7 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dclre1bQ8C7W7 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dclre1bQ8C7W7 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dclre1bQ8C7W7 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dclre1bQ8C7W7 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dclre1bQ8C7W7 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dclre1bQ8C7W7 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dclre1bQ8C7W7 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dclre1bQ8C7W7 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dclre1bQ8C7W7 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dclre1bQ8C7W7 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dclre1bQ8C7W7 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dclre1bQ8C7W7 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dclre1bQ8C7W7 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dclre1bQ8C7W7 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dclre1bQ8C7W7 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dclre1bQ8C7W7 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dclre1bQ8C7W7 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dclre1bQ8C7W7 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dclre1bQ8C7W7 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dclre1bQ8C7W7 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dclre1bQ8C7W7 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dclre1bQ8C7W7 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dclre1bQ8C7W7 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dclre1bQ8C7W7 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dclre1bQ8C7W7 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dclre1bQ8C7W7 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dclre1bQ8C7W7 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Dclre1bQ8C7W7 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Dclre1bQ8C7W7 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dclre1bQ8C7W7 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dclre1bQ8C7W7 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dclre1bQ8C7W7 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dclre1bQ8C7W7 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dclre1bQ8C7W7 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Dclre1bQ8C7W7 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Dclre1bQ8C7W7 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Dclre1bQ8C7W7 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dclre1bQ8C7W7 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dclre1bQ8C7W7 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dclre1bQ8C7W7 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dclre1bQ8C7W7 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Dclre1bQ8C7W7 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dclre1bQ8C7W7 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Dclre1bQ8C7W7 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dclre1bQ8C7W7 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Dclre1bQ8C7W7 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Dclre1bQ8C7W7 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dclre1bQ8C7W7 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dclre1bQ8C7W7 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dclre1bQ8C7W7 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dclre1bQ8C7W7 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dclre1bQ8C7W7 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dclre1bQ8C7W7 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dclre1bQ8C7W7 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dclre1bQ8C7W7 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dclre1bQ8C7W7 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dclre1bQ8C7W7 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dclre1bQ8C7W7 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dclre1bQ8C7W7 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dclre1bQ8C7W7 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dclre1bQ8C7W7 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dclre1bQ8C7W7 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dclre1bQ8C7W7 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dclre1bQ8C7W7 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Dclre1bQ8C7W7 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dclre1bQ8C7W7 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dclre1bQ8C7W7 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Dclre1bQ8C7W7 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dclre1bQ8C7W7 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Dclre1bQ8C7W7 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dclre1bQ8C7W7 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dclre1bQ8C7W7 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms