Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6A8

Bhlhe22, Class E basic helix-loop-helix protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe22Q8C6A8 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bhlhe22Q8C6A8 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Bhlhe22Q8C6A8 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bhlhe22Q8C6A8 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bhlhe22Q8C6A8 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bhlhe22Q8C6A8 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bhlhe22Q8C6A8 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bhlhe22Q8C6A8 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bhlhe22Q8C6A8 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bhlhe22Q8C6A8 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bhlhe22Q8C6A8 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bhlhe22Q8C6A8 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bhlhe22Q8C6A8 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bhlhe22Q8C6A8 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bhlhe22Q8C6A8 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bhlhe22Q8C6A8 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bhlhe22Q8C6A8 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bhlhe22Q8C6A8 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bhlhe22Q8C6A8 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bhlhe22Q8C6A8 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Bhlhe22Q8C6A8 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bhlhe22Q8C6A8 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bhlhe22Q8C6A8 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Bhlhe22Q8C6A8 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bhlhe22Q8C6A8 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bhlhe22Q8C6A8 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bhlhe22Q8C6A8 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bhlhe22Q8C6A8 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bhlhe22Q8C6A8 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bhlhe22Q8C6A8 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bhlhe22Q8C6A8 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bhlhe22Q8C6A8 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bhlhe22Q8C6A8 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bhlhe22Q8C6A8 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bhlhe22Q8C6A8 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bhlhe22Q8C6A8 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bhlhe22Q8C6A8 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bhlhe22Q8C6A8 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bhlhe22Q8C6A8 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bhlhe22Q8C6A8 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bhlhe22Q8C6A8 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bhlhe22Q8C6A8 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Bhlhe22Q8C6A8 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bhlhe22Q8C6A8 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bhlhe22Q8C6A8 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bhlhe22Q8C6A8 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bhlhe22Q8C6A8 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bhlhe22Q8C6A8 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bhlhe22Q8C6A8 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bhlhe22Q8C6A8 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bhlhe22Q8C6A8 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bhlhe22Q8C6A8 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bhlhe22Q8C6A8 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bhlhe22Q8C6A8 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bhlhe22Q8C6A8 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bhlhe22Q8C6A8 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bhlhe22Q8C6A8 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bhlhe22Q8C6A8 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bhlhe22Q8C6A8 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bhlhe22Q8C6A8 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bhlhe22Q8C6A8 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bhlhe22Q8C6A8 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bhlhe22Q8C6A8 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bhlhe22Q8C6A8 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bhlhe22Q8C6A8 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bhlhe22Q8C6A8 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bhlhe22Q8C6A8 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Bhlhe22Q8C6A8 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bhlhe22Q8C6A8 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bhlhe22Q8C6A8 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bhlhe22Q8C6A8 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bhlhe22Q8C6A8 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bhlhe22Q8C6A8 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bhlhe22Q8C6A8 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bhlhe22Q8C6A8 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bhlhe22Q8C6A8 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bhlhe22Q8C6A8 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bhlhe22Q8C6A8 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bhlhe22Q8C6A8 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bhlhe22Q8C6A8 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Bhlhe22Q8C6A8 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Bhlhe22Q8C6A8 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bhlhe22Q8C6A8 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bhlhe22Q8C6A8 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bhlhe22Q8C6A8 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bhlhe22Q8C6A8 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bhlhe22Q8C6A8 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bhlhe22Q8C6A8 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bhlhe22Q8C6A8 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bhlhe22Q8C6A8 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bhlhe22Q8C6A8 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bhlhe22Q8C6A8 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bhlhe22Q8C6A8 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bhlhe22Q8C6A8 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bhlhe22Q8C6A8 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bhlhe22Q8C6A8 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bhlhe22Q8C6A8 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bhlhe22Q8C6A8 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bhlhe22Q8C6A8 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Bhlhe22Q8C6A8 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms