Protein–RNA interactions for Protein: Q8C570

Rae1, mRNA export factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rae1Q8C570 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rae1Q8C570 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rae1Q8C570 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rae1Q8C570 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rae1Q8C570 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rae1Q8C570 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rae1Q8C570 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rae1Q8C570 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rae1Q8C570 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rae1Q8C570 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rae1Q8C570 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rae1Q8C570 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rae1Q8C570 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rae1Q8C570 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rae1Q8C570 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rae1Q8C570 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rae1Q8C570 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rae1Q8C570 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rae1Q8C570 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rae1Q8C570 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rae1Q8C570 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rae1Q8C570 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rae1Q8C570 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rae1Q8C570 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rae1Q8C570 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rae1Q8C570 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rae1Q8C570 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rae1Q8C570 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rae1Q8C570 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rae1Q8C570 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rae1Q8C570 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rae1Q8C570 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rae1Q8C570 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rae1Q8C570 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rae1Q8C570 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rae1Q8C570 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rae1Q8C570 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rae1Q8C570 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rae1Q8C570 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rae1Q8C570 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rae1Q8C570 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rae1Q8C570 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rae1Q8C570 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rae1Q8C570 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rae1Q8C570 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rae1Q8C570 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rae1Q8C570 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rae1Q8C570 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Rae1Q8C570 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rae1Q8C570 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rae1Q8C570 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rae1Q8C570 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rae1Q8C570 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rae1Q8C570 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rae1Q8C570 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rae1Q8C570 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rae1Q8C570 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Rae1Q8C570 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rae1Q8C570 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rae1Q8C570 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rae1Q8C570 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rae1Q8C570 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rae1Q8C570 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rae1Q8C570 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rae1Q8C570 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rae1Q8C570 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rae1Q8C570 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rae1Q8C570 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rae1Q8C570 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rae1Q8C570 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rae1Q8C570 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rae1Q8C570 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rae1Q8C570 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rae1Q8C570 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rae1Q8C570 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rae1Q8C570 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rae1Q8C570 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rae1Q8C570 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rae1Q8C570 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rae1Q8C570 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rae1Q8C570 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rae1Q8C570 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rae1Q8C570 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rae1Q8C570 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rae1Q8C570 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rae1Q8C570 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rae1Q8C570 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rae1Q8C570 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rae1Q8C570 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rae1Q8C570 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rae1Q8C570 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rae1Q8C570 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rae1Q8C570 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rae1Q8C570 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rae1Q8C570 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rae1Q8C570 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rae1Q8C570 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rae1Q8C570 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rae1Q8C570 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rae1Q8C570 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.9 ms