Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1B2

Tiparp, TCDD-inducible poly [ADP-ribose] polymerase, mousemouse

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TiparpQ8C1B2 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TiparpQ8C1B2 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TiparpQ8C1B2 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TiparpQ8C1B2 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TiparpQ8C1B2 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TiparpQ8C1B2 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TiparpQ8C1B2 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TiparpQ8C1B2 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TiparpQ8C1B2 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TiparpQ8C1B2 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TiparpQ8C1B2 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TiparpQ8C1B2 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TiparpQ8C1B2 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TiparpQ8C1B2 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TiparpQ8C1B2 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
TiparpQ8C1B2 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TiparpQ8C1B2 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TiparpQ8C1B2 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TiparpQ8C1B2 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TiparpQ8C1B2 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TiparpQ8C1B2 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TiparpQ8C1B2 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TiparpQ8C1B2 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TiparpQ8C1B2 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TiparpQ8C1B2 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TiparpQ8C1B2 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TiparpQ8C1B2 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TiparpQ8C1B2 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TiparpQ8C1B2 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TiparpQ8C1B2 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TiparpQ8C1B2 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TiparpQ8C1B2 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TiparpQ8C1B2 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TiparpQ8C1B2 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TiparpQ8C1B2 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TiparpQ8C1B2 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TiparpQ8C1B2 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TiparpQ8C1B2 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TiparpQ8C1B2 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TiparpQ8C1B2 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TiparpQ8C1B2 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TiparpQ8C1B2 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TiparpQ8C1B2 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TiparpQ8C1B2 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TiparpQ8C1B2 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TiparpQ8C1B2 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TiparpQ8C1B2 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TiparpQ8C1B2 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TiparpQ8C1B2 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TiparpQ8C1B2 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TiparpQ8C1B2 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TiparpQ8C1B2 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TiparpQ8C1B2 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TiparpQ8C1B2 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TiparpQ8C1B2 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TiparpQ8C1B2 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TiparpQ8C1B2 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TiparpQ8C1B2 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TiparpQ8C1B2 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TiparpQ8C1B2 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TiparpQ8C1B2 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TiparpQ8C1B2 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TiparpQ8C1B2 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TiparpQ8C1B2 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TiparpQ8C1B2 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TiparpQ8C1B2 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TiparpQ8C1B2 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TiparpQ8C1B2 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TiparpQ8C1B2 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TiparpQ8C1B2 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TiparpQ8C1B2 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TiparpQ8C1B2 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TiparpQ8C1B2 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TiparpQ8C1B2 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TiparpQ8C1B2 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TiparpQ8C1B2 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TiparpQ8C1B2 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TiparpQ8C1B2 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TiparpQ8C1B2 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TiparpQ8C1B2 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TiparpQ8C1B2 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TiparpQ8C1B2 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TiparpQ8C1B2 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TiparpQ8C1B2 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TiparpQ8C1B2 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TiparpQ8C1B2 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TiparpQ8C1B2 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TiparpQ8C1B2 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TiparpQ8C1B2 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TiparpQ8C1B2 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TiparpQ8C1B2 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TiparpQ8C1B2 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TiparpQ8C1B2 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TiparpQ8C1B2 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TiparpQ8C1B2 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TiparpQ8C1B2 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TiparpQ8C1B2 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TiparpQ8C1B2 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TiparpQ8C1B2 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TiparpQ8C1B2 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms