Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim35Q8C006 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim35Q8C006 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim35Q8C006 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim35Q8C006 Gm19210-201ENSMUST00000199562 1350 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim35Q8C006 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim35Q8C006 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim35Q8C006 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim35Q8C006 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim35Q8C006 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim35Q8C006 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim35Q8C006 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim35Q8C006 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim35Q8C006 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim35Q8C006 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim35Q8C006 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim35Q8C006 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim35Q8C006 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim35Q8C006 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim35Q8C006 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim35Q8C006 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim35Q8C006 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim35Q8C006 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim35Q8C006 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim35Q8C006 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim35Q8C006 Mrps36-ps3-201ENSMUST00000183899 305 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim35Q8C006 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim35Q8C006 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim35Q8C006 Olfr563-ps1-201ENSMUST00000210909 873 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim35Q8C006 AC147101.1-201ENSMUST00000217964 312 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim35Q8C006 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim35Q8C006 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim35Q8C006 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim35Q8C006 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim35Q8C006 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim35Q8C006 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim35Q8C006 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim35Q8C006 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim35Q8C006 Skint10-201ENSMUST00000060327 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim35Q8C006 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim35Q8C006 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim35Q8C006 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim35Q8C006 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim35Q8C006 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim35Q8C006 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim35Q8C006 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim35Q8C006 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim35Q8C006 Prr27-201ENSMUST00000002310 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim35Q8C006 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim35Q8C006 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim35Q8C006 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim35Q8C006 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim35Q8C006 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim35Q8C006 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim35Q8C006 Gm10012-202ENSMUST00000170379 372 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim35Q8C006 Esp16-201ENSMUST00000178037 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim35Q8C006 Gm28438-201ENSMUST00000188299 345 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim35Q8C006 Gm18348-201ENSMUST00000191227 820 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim35Q8C006 Gm5708-201ENSMUST00000196289 886 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim35Q8C006 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim35Q8C006 Olfr870-201ENSMUST00000086476 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim35Q8C006 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim35Q8C006 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim35Q8C006 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim35Q8C006 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim35Q8C006 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim35Q8C006 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim35Q8C006 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim35Q8C006 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim35Q8C006 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim35Q8C006 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim35Q8C006 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim35Q8C006 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim35Q8C006 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim35Q8C006 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim35Q8C006 1700016H13Rik-202ENSMUST00000119824 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim35Q8C006 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim35Q8C006 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim35Q8C006 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim35Q8C006 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim35Q8C006 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim35Q8C006 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim35Q8C006 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim35Q8C006 Gm26563-202ENSMUST00000181152 1931 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim35Q8C006 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim35Q8C006 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim35Q8C006 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim35Q8C006 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim35Q8C006 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim35Q8C006 Prl8a6-203ENSMUST00000110355 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim35Q8C006 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim35Q8C006 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim35Q8C006 C920009B18Rik-203ENSMUST00000181643 1004 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim35Q8C006 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim35Q8C006 Gm32884-201ENSMUST00000205528 732 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim35Q8C006 Gm44681-201ENSMUST00000208447 842 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim35Q8C006 Gm19572-201ENSMUST00000214326 338 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim35Q8C006 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim35Q8C006 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim35Q8C006 Olfr843-201ENSMUST00000061365 1107 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
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