Protein–RNA interactions for Protein: Q8BYM7

Rsph4a, Radial spoke head protein 4 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 716 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph4aQ8BYM7 Gm20854-201ENSMUST00000178889 1002 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rsph4aQ8BYM7 Gm37629-201ENSMUST00000193635 1050 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Rsph4aQ8BYM7 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rsph4aQ8BYM7 AC153512.2-201ENSMUST00000220363 1273 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rsph4aQ8BYM7 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rsph4aQ8BYM7 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rsph4aQ8BYM7 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rsph4aQ8BYM7 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rsph4aQ8BYM7 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rsph4aQ8BYM7 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rsph4aQ8BYM7 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rsph4aQ8BYM7 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rsph4aQ8BYM7 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rsph4aQ8BYM7 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rsph4aQ8BYM7 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rsph4aQ8BYM7 Tbata-209ENSMUST00000148181 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rsph4aQ8BYM7 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Rsph4aQ8BYM7 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rsph4aQ8BYM7 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rsph4aQ8BYM7 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rsph4aQ8BYM7 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rsph4aQ8BYM7 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rsph4aQ8BYM7 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rsph4aQ8BYM7 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rsph4aQ8BYM7 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rsph4aQ8BYM7 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rsph4aQ8BYM7 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Rsph4aQ8BYM7 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rsph4aQ8BYM7 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rsph4aQ8BYM7 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rsph4aQ8BYM7 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rsph4aQ8BYM7 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rsph4aQ8BYM7 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rsph4aQ8BYM7 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rsph4aQ8BYM7 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rsph4aQ8BYM7 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rsph4aQ8BYM7 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rsph4aQ8BYM7 Fopnl-202ENSMUST00000120707 1414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rsph4aQ8BYM7 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rsph4aQ8BYM7 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rsph4aQ8BYM7 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rsph4aQ8BYM7 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rsph4aQ8BYM7 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rsph4aQ8BYM7 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Rsph4aQ8BYM7 Gm18595-201ENSMUST00000175736 1068 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Rsph4aQ8BYM7 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rsph4aQ8BYM7 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Rsph4aQ8BYM7 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rsph4aQ8BYM7 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rsph4aQ8BYM7 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rsph4aQ8BYM7 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rsph4aQ8BYM7 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rsph4aQ8BYM7 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rsph4aQ8BYM7 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rsph4aQ8BYM7 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rsph4aQ8BYM7 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rsph4aQ8BYM7 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Rsph4aQ8BYM7 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rsph4aQ8BYM7 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rsph4aQ8BYM7 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rsph4aQ8BYM7 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rsph4aQ8BYM7 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Rsph4aQ8BYM7 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Rsph4aQ8BYM7 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Rsph4aQ8BYM7 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Rsph4aQ8BYM7 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rsph4aQ8BYM7 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rsph4aQ8BYM7 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rsph4aQ8BYM7 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rsph4aQ8BYM7 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rsph4aQ8BYM7 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rsph4aQ8BYM7 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rsph4aQ8BYM7 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Rsph4aQ8BYM7 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rsph4aQ8BYM7 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rsph4aQ8BYM7 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rsph4aQ8BYM7 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rsph4aQ8BYM7 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rsph4aQ8BYM7 Gm25116-201ENSMUST00000157191 122 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Rsph4aQ8BYM7 Gm15716-201ENSMUST00000162457 404 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rsph4aQ8BYM7 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rsph4aQ8BYM7 Gm19990-201ENSMUST00000219468 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rsph4aQ8BYM7 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Rsph4aQ8BYM7 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rsph4aQ8BYM7 1700011I03Rik-201ENSMUST00000079738 1013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rsph4aQ8BYM7 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rsph4aQ8BYM7 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rsph4aQ8BYM7 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rsph4aQ8BYM7 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rsph4aQ8BYM7 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rsph4aQ8BYM7 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rsph4aQ8BYM7 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rsph4aQ8BYM7 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rsph4aQ8BYM7 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rsph4aQ8BYM7 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rsph4aQ8BYM7 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rsph4aQ8BYM7 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Rsph4aQ8BYM7 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rsph4aQ8BYM7 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rsph4aQ8BYM7 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.3 ms