Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXL9

Iffo1, Intermediate filament family orphan 1, mousemouse

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Length 562 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Iffo1Q8BXL9 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Iffo1Q8BXL9 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Iffo1Q8BXL9 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Iffo1Q8BXL9 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Iffo1Q8BXL9 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Iffo1Q8BXL9 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Iffo1Q8BXL9 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Iffo1Q8BXL9 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Iffo1Q8BXL9 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Iffo1Q8BXL9 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Iffo1Q8BXL9 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Iffo1Q8BXL9 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Iffo1Q8BXL9 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Iffo1Q8BXL9 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Iffo1Q8BXL9 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Iffo1Q8BXL9 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Iffo1Q8BXL9 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Iffo1Q8BXL9 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Iffo1Q8BXL9 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Iffo1Q8BXL9 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Iffo1Q8BXL9 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Iffo1Q8BXL9 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Iffo1Q8BXL9 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Iffo1Q8BXL9 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Iffo1Q8BXL9 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Iffo1Q8BXL9 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Iffo1Q8BXL9 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Iffo1Q8BXL9 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Iffo1Q8BXL9 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Iffo1Q8BXL9 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Iffo1Q8BXL9 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Iffo1Q8BXL9 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Iffo1Q8BXL9 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Iffo1Q8BXL9 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Iffo1Q8BXL9 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Iffo1Q8BXL9 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Iffo1Q8BXL9 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Iffo1Q8BXL9 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Iffo1Q8BXL9 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Iffo1Q8BXL9 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Iffo1Q8BXL9 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Iffo1Q8BXL9 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Iffo1Q8BXL9 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Iffo1Q8BXL9 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Iffo1Q8BXL9 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Iffo1Q8BXL9 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Iffo1Q8BXL9 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Iffo1Q8BXL9 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Iffo1Q8BXL9 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Iffo1Q8BXL9 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Iffo1Q8BXL9 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Iffo1Q8BXL9 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Iffo1Q8BXL9 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Iffo1Q8BXL9 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Iffo1Q8BXL9 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Iffo1Q8BXL9 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Iffo1Q8BXL9 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Iffo1Q8BXL9 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Iffo1Q8BXL9 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Iffo1Q8BXL9 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Iffo1Q8BXL9 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Iffo1Q8BXL9 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Iffo1Q8BXL9 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Iffo1Q8BXL9 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Iffo1Q8BXL9 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Iffo1Q8BXL9 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Iffo1Q8BXL9 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Iffo1Q8BXL9 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Iffo1Q8BXL9 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Iffo1Q8BXL9 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Iffo1Q8BXL9 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Iffo1Q8BXL9 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Iffo1Q8BXL9 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Iffo1Q8BXL9 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Iffo1Q8BXL9 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Iffo1Q8BXL9 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Iffo1Q8BXL9 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Iffo1Q8BXL9 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Iffo1Q8BXL9 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Iffo1Q8BXL9 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Iffo1Q8BXL9 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Iffo1Q8BXL9 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Iffo1Q8BXL9 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Iffo1Q8BXL9 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Iffo1Q8BXL9 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Iffo1Q8BXL9 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Iffo1Q8BXL9 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Iffo1Q8BXL9 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Iffo1Q8BXL9 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Iffo1Q8BXL9 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Iffo1Q8BXL9 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Iffo1Q8BXL9 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Iffo1Q8BXL9 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Iffo1Q8BXL9 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Iffo1Q8BXL9 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Iffo1Q8BXL9 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
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