Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX22

Sall4, Sal-like protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,067 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall4Q8BX22 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sall4Q8BX22 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sall4Q8BX22 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sall4Q8BX22 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sall4Q8BX22 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sall4Q8BX22 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sall4Q8BX22 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sall4Q8BX22 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sall4Q8BX22 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sall4Q8BX22 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sall4Q8BX22 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sall4Q8BX22 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sall4Q8BX22 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sall4Q8BX22 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sall4Q8BX22 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sall4Q8BX22 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sall4Q8BX22 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sall4Q8BX22 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sall4Q8BX22 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sall4Q8BX22 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sall4Q8BX22 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sall4Q8BX22 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Sall4Q8BX22 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sall4Q8BX22 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Sall4Q8BX22 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sall4Q8BX22 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Sall4Q8BX22 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sall4Q8BX22 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Sall4Q8BX22 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sall4Q8BX22 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sall4Q8BX22 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sall4Q8BX22 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sall4Q8BX22 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sall4Q8BX22 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sall4Q8BX22 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sall4Q8BX22 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sall4Q8BX22 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sall4Q8BX22 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sall4Q8BX22 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sall4Q8BX22 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sall4Q8BX22 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sall4Q8BX22 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sall4Q8BX22 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sall4Q8BX22 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sall4Q8BX22 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sall4Q8BX22 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sall4Q8BX22 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sall4Q8BX22 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sall4Q8BX22 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sall4Q8BX22 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sall4Q8BX22 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sall4Q8BX22 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sall4Q8BX22 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sall4Q8BX22 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Sall4Q8BX22 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sall4Q8BX22 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sall4Q8BX22 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sall4Q8BX22 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sall4Q8BX22 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sall4Q8BX22 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sall4Q8BX22 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sall4Q8BX22 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sall4Q8BX22 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sall4Q8BX22 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sall4Q8BX22 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sall4Q8BX22 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sall4Q8BX22 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sall4Q8BX22 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sall4Q8BX22 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sall4Q8BX22 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sall4Q8BX22 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sall4Q8BX22 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sall4Q8BX22 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sall4Q8BX22 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sall4Q8BX22 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sall4Q8BX22 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sall4Q8BX22 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sall4Q8BX22 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sall4Q8BX22 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sall4Q8BX22 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sall4Q8BX22 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sall4Q8BX22 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sall4Q8BX22 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sall4Q8BX22 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sall4Q8BX22 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sall4Q8BX22 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Sall4Q8BX22 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sall4Q8BX22 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sall4Q8BX22 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sall4Q8BX22 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sall4Q8BX22 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Sall4Q8BX22 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sall4Q8BX22 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sall4Q8BX22 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sall4Q8BX22 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sall4Q8BX22 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sall4Q8BX22 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sall4Q8BX22 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sall4Q8BX22 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sall4Q8BX22 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms