Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ctdsp2Q8BX07 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ctdsp2Q8BX07 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ctdsp2Q8BX07 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ctdsp2Q8BX07 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ctdsp2Q8BX07 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ctdsp2Q8BX07 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ctdsp2Q8BX07 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Ctdsp2Q8BX07 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ctdsp2Q8BX07 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ctdsp2Q8BX07 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ctdsp2Q8BX07 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ctdsp2Q8BX07 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ctdsp2Q8BX07 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ctdsp2Q8BX07 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ctdsp2Q8BX07 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ctdsp2Q8BX07 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ctdsp2Q8BX07 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ctdsp2Q8BX07 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ctdsp2Q8BX07 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ctdsp2Q8BX07 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ctdsp2Q8BX07 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ctdsp2Q8BX07 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ctdsp2Q8BX07 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ctdsp2Q8BX07 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ctdsp2Q8BX07 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ctdsp2Q8BX07 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ctdsp2Q8BX07 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ctdsp2Q8BX07 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ctdsp2Q8BX07 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ctdsp2Q8BX07 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ctdsp2Q8BX07 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ctdsp2Q8BX07 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ctdsp2Q8BX07 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ctdsp2Q8BX07 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ctdsp2Q8BX07 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ctdsp2Q8BX07 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ctdsp2Q8BX07 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ctdsp2Q8BX07 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ctdsp2Q8BX07 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ctdsp2Q8BX07 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ctdsp2Q8BX07 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ctdsp2Q8BX07 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Ctdsp2Q8BX07 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ctdsp2Q8BX07 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ctdsp2Q8BX07 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ctdsp2Q8BX07 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ctdsp2Q8BX07 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ctdsp2Q8BX07 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ctdsp2Q8BX07 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ctdsp2Q8BX07 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ctdsp2Q8BX07 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ctdsp2Q8BX07 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ctdsp2Q8BX07 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ctdsp2Q8BX07 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ctdsp2Q8BX07 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ctdsp2Q8BX07 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ctdsp2Q8BX07 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ctdsp2Q8BX07 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ctdsp2Q8BX07 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ctdsp2Q8BX07 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ctdsp2Q8BX07 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ctdsp2Q8BX07 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ctdsp2Q8BX07 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Ctdsp2Q8BX07 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Ctdsp2Q8BX07 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Ctdsp2Q8BX07 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ctdsp2Q8BX07 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Ctdsp2Q8BX07 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ctdsp2Q8BX07 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ctdsp2Q8BX07 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ctdsp2Q8BX07 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ctdsp2Q8BX07 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ctdsp2Q8BX07 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ctdsp2Q8BX07 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ctdsp2Q8BX07 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ctdsp2Q8BX07 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ctdsp2Q8BX07 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ctdsp2Q8BX07 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ctdsp2Q8BX07 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ctdsp2Q8BX07 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ctdsp2Q8BX07 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ctdsp2Q8BX07 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ctdsp2Q8BX07 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ctdsp2Q8BX07 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ctdsp2Q8BX07 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ctdsp2Q8BX07 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ctdsp2Q8BX07 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ctdsp2Q8BX07 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ctdsp2Q8BX07 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ctdsp2Q8BX07 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ctdsp2Q8BX07 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ctdsp2Q8BX07 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
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